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flybennylee

铁虫 (初入文坛)

[求助] 酵母基因型怎么解读

基因型写成这样:MATα;ura3-52;leu2-3;112;his3Δ200;trp1Δ;lys2Δ201;GAL2;MRD1-ΔRBD5-HTP-TRP1;PGAL-HA-MRD1:URA3
它到底是什么意思?完全看不懂这是什么意思。急求回答,或者有解释这样的书吗?
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flybennylee

铁虫 (初入文坛)

自己顶一个,求回复啊。急啊
2楼2013-10-09 16:29:13
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+3, 鼓励热心应助! 2013-10-10 19:07:46
个人认为,你写的一些基因型根本就是错的。

在酵母系统中,在提到某个基因时,要用大写斜体标注(而不是小写),如 OCH1,ZWF1, GSHI等,如果该基因敲除,应用小写斜体,如och1 mutant
(斜体在前用汉语标注,注意)

看你的标注,有几个是属于细菌的。delta是敲除的意思,冒号不能肯定。你写的基本都是是引入载体的名称,而不是酵母的命名。
3楼2013-10-09 16:59:58
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

冒号应该不是这样用的,之前看过一篇文献是双冒号::,详见Development of an anhydrotetracycline-inducible gene expression system for solvent-producing Clostridium acetobutylicum: A useful tool for strain engineering。具体在Table 1。你可以借鉴看看
4楼2013-10-09 19:08:14
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flybennylee

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by reallpf at 2013-10-09 16:59:58
个人认为,你写的一些基因型根本就是错的。

在酵母系统中,在提到某个基因时,要用大写斜体标注(而不是小写),如 OCH1,ZWF1, GSHI等,如果该基因敲除,应用小写斜体,如och1 mutant
(斜体在前用汉语标注, ...

是的。文献中是斜体,但是粘贴上来就不是斜体了。但是大小写没错。我就不懂“-”前后数字是什么意思,然后双冒号前后什么意思。MATα;ura3-52;leu2-3;112;his3Δ200;trp1Δ;lys2Δ201;GAL2;MRD1-ΔRBD5-HTP-TRP1;PGAL-HA-MRD1::URA3
那这个基因型到底表示什么呢?
5楼2013-10-10 12:08:57
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

双冒号看我回给你的那篇文献,材料与方法中Table 1。“-”就是连接符,数字应该就是和基因连在一起的编号(如斜体HIS4),或者在序列中碱基的描述。
6楼2013-10-10 16:30:47
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