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70712023新虫 (初入文坛)
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[求助]
蛋白质酶解中Sequence coverage 高有什么意义？
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| 现在主要在对提高酶对蛋白质的酶解效率进行研究，蛋白质经我们制备的酶反应器酶解后，Sequence coverage 和 matched peptides 提高了，我想知道Sequence coverage 和matched peptides 提高了有什么意义，为什么要用这两个参数来表示。。然后为什么固定的酶多了Sequence coverage 和 matched peptides 会提高，最后有相关的文献看看~谢谢了，急急急 |
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seallinsky
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【答案】应助回帖
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70712023: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2013-10-23 14:41:21
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| Sequence coverage是鉴定到的peptide与理论酶切的peptide对比的一个比值，高了说明你酶切的更加充分，漏切的肽段少，说明你的酶反应器比较好，同样，matched peptides就是匹配上的肽段，越多说明鉴定的可靠性越高。因为固定的酶多了，所以漏切的比率就更低了，所以序列的覆盖率就更高了呗。至于文献，你搜搜（固定化没反应器，IMER）肯定有很多的文章，我知道的国内就有大连化物所、复旦、交大、军科院等单位这方面都做的不错 |
2楼2013-10-10 23:40:47
