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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 小弟已经泪崩，跪求大神搭救。。。
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ning007

铜虫 (小有名气)

[交流] 小弟已经泪崩，跪求大神搭救。。。

这个假期都在弄MS了，可是遇到个问题：从库里调出Er金属单胞（两个原子）进行几何优化（想计算它的形成能），可是怎么设置参数都收敛不了（empty bands都调到35%，smearing0.05到了）! 已经确定软件是没问题（从库里调出Zn金属单胞能计算并且收敛），跪求大神搭救！参数设置以及报错信息见图！
小弟已经泪崩，跪求大神搭救。。。
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小弟已经泪崩，跪求大神搭救。。。-1
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小弟已经泪崩，跪求大神搭救。。。-2
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小弟已经泪崩，跪求大神搭救。。。-3
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小弟已经泪崩，跪求大神搭救。。。-4
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小弟已经泪崩，跪求大神搭救。。。-5
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小弟已经泪崩，跪求大神搭救。。。-6
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1楼 2013-10-06 16:34:27
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
identation: 金币+2, 谢谢指教 2013-10-06 22:34:09
百度之：铒为银白色金属；熔点1529°C，沸点2863°C，密度9.006克/厘米^3；；铒在低温下是反铁磁性的，在接近绝对零度时为强铁磁性，并为超导体。
显然要在你的第三幅图选上spin polar，另外建议尽量不要用fine以下的精度。
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2楼2013-10-06 19:15:08
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371131990

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
identation: 金币+2, 谢谢指导 2013-10-07 12:44:15
显然没有收敛嘛，将max scf circle 增加到300试一试。
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3楼2013-10-06 20:31:56
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益达木糖醇

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
大哥，怎么看收敛与否啊？？？泪奔，新手各种不会啊
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4楼2013-10-07 10:41:40
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371131990

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-10-07 21:09:54
引用回帖:
4楼: Originally posted by 益达木糖醇 at 2013-10-07 10:41:40
大哥，怎么看收敛与否啊？？？泪奔，新手各种不会啊

第5副图中error信息中可以看出来是否收敛
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5楼2013-10-07 14:49:58
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益达木糖醇

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
内容已删除
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6楼2013-10-07 17:23:42
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ning007

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2013-10-06 19:15:08
百度之：铒为银白色金属；熔点1529°C，沸点2863°C，密度9.006克/厘米^3；；铒在低温下是反铁磁性的，在接近绝对零度时为强铁磁性，并为超导体。
显然要在你的第三幅图选上spin polar，另外建议尽量不要用fine以下 ...

没用啊，先是只选上spin polarized算，不收敛；我有在modify—electronic configuration里给两个原子分别弄了spin state/direction，还是不收敛啊！
小弟已经泪崩，跪求大神搭救。。。-7
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7楼2013-10-07 18:37:07
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ning007

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 371131990 at 2013-10-06 20:31:56
显然没有收敛嘛，将max scf circle 增加到300试一试。

我都加到4000了  还是收敛不了啊！
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8楼2013-10-07 18:38:03
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371131990

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-10-07 21:10:14
内容已删除
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9楼2013-10-07 18:40:20
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ning007

铜虫 (小有名气)
自己再顶一下，希望看到此贴的高手算一下，胞挺小的  就两原子！大家交流最重要哈。。。
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10楼2013-10-07 18:43:06
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益达木糖醇

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-10-07 21:10:23
引用回帖:
9楼: Originally posted by 371131990 at 2013-10-07 18:40:20
肯定要进行收敛测试啊...

额，先进性收敛性测试，后几何优化，是这样吧？测试的时候Task选能量，对么？
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11楼2013-10-07 18:48:11
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371131990

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by ning007 at 2013-10-07 18:38:03
我都加到4000了  还是收敛不了啊！...

牛，你的机器配置看来不错啊
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12楼2013-10-07 18:50:54
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371131990

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-10-07 21:10:37
引用回帖:
11楼: Originally posted by 益达木糖醇 at 2013-10-07 18:48:11
额，先进性收敛性测试，后几何优化，是这样吧？测试的时候Task选能量，对么？...

根据abinit，pwscf使用方法，是先进行收敛测试，在几何优化
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13楼2013-10-07 18:54:15
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ning007

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 371131990 at 2013-10-07 18:50:54
牛，你的机器配置看来不错啊...

就两原子，一般的配置也能搞定啊。。。关键是哪里出错了？找不出来，一天时间又白瞎了。。。
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14楼2013-10-07 18:58:46
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
franch: 金币+3, 谢谢回帖交流 2013-10-07 21:10:47
ning007: 金币+3, 太感谢了，直接切中要点，希望能继续交流。。。 2013-10-07 22:58:17
引用回帖:
14楼: Originally posted by ning007 at 2013-10-07 18:58:46
就两原子，一般的配置也能搞定啊。。。关键是哪里出错了？找不出来，一天时间又白瞎了。。。...

我昨天试过加上spin polar单点medium可以收敛（按照你的smearing=0.05eV，empty band=35%），我不确定是不是在geom opt的某个点出问题的，我现在手头上没ms，你给出的信息不够详尽，要不然明天到学校再帮你处理，再给你答复。

总之从此情形来看spin polar肯定需要考虑。如果不收敛首先考虑继续提升精度，试试ultrafine，就算2core一样算得动，稍微慢一点（试过）。

当然，从你的结果上看应该没有做过收敛性测试，即Ecut和k-point的选取都未测试，有时候不当的Ecut和k不但会造成不好的结果，甚至难以收敛也很正常。

当然，上述工作如果你都做了，就可以进一步考虑其他收敛方法的调整。就另外再说了。
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15楼2013-10-07 20:34:39
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益达木糖醇

木虫 (著名写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 371131990 at 2013-10-07 18:54:15
根据abinit，pwscf使用方法，是先进行收敛测试，在几何优化...

谢谢指点，
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16楼2013-10-07 21:14:50
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XCHuang

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
有可能是你的电脑内存不足导致的吧。如果有条件的话可以换个大点的服务器算算看，或是尽量降低k点数量和cutoff的数值算算看。
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17楼2013-10-07 21:25:20
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zmrright

金虫 (著名写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
ning007: 金币+1, 谢谢回复。。。 2013-10-10 08:38:26
稀土很难收敛，这个正常！解决方法，换赝势，收敛精度，循环次数大，DIIS改大，最后就是分步优化！

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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18楼2013-10-08 08:39:11
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Toapollo

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
空带数目过多！
迭代次数严重不足！

修正这两个问题，收敛一定解决。
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19楼2013-10-08 09:46:44
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼上说的对，空带数目确实不宜过多。
你的优化做到第几部scf发散？我用我们这的服务器check了一下，算了20多step都没啥问题（Medium精度）。前提就像前面说的，必须考虑spin polar。
scf的maxcycle你设置多少？我建议调到250.我迭代scf中出现的maxcycle为108。
你再试试。
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20楼2013-10-08 14:08:44
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Toapollo

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
ning007: 金币+1, 谢谢热心回复。。。 2013-10-10 08:37:16
我已经验算过了，SCF最多104步收敛，大多数在50-80之间。
你应该是某个地方设置错误的了。
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21楼2013-10-09 12:33:22
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chimegreen

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
18楼: Originally posted by zmrright at 2013-10-08 08:39:11
稀土很难收敛，这个正常！解决方法，换赝势，收敛精度，循环次数大，DIIS改大，最后就是分步优化！

赞同这位朋友的策略。
不过看楼主的错误信息，不仅仅是收敛的问题好像。
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22楼2013-10-10 09:20:03
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zmrright

金虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
22楼: Originally posted by chimegreen at 2013-10-10 09:20:03
赞同这位朋友的策略。
不过看楼主的错误信息，不仅仅是收敛的问题好像。...

你认为还有什么问题呢？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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23楼2013-10-10 10:43:17
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ning007

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
23楼: Originally posted by zmrright at 2013-10-10 10:43:17
你认为还有什么问题呢？
...

同求问。。。
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24楼2013-10-10 13:37:22
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chimegreen

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
23楼: Originally posted by zmrright at 2013-10-10 10:43:17
你认为还有什么问题呢？
...

看错误信息，我怎么觉得你安装都没安好呢？
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25楼2013-10-11 09:09:58
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fengqingyeli

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我也刚开始学这个，替楼主顶一下。
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26楼2013-10-12 18:48:54
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ning007

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
25楼: Originally posted by chimegreen at 2013-10-11 09:09:58
看错误信息，我怎么觉得你安装都没安好呢？...

  应该是安装好了  问题已解决。。。
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27楼2013-10-15 13:20:37
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