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菲常亦可

新虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 211.5
红花: 1
帖子: 63
在线: 38.3小时
虫号: 1687381
注册: 2012-03-13
专业: 合成药物化学

[求助] 关于薛定谔软件对接结果保存问题

新人学用薛定谔做分子对接，首先收集到的分子用ligprep优化，然后蛋白质形成格点，对接。对接结果中一个分子有很多个对接打分，但是我只想保留打分最低的一个，应该怎么操作呢？因为后期数据处理复杂，所以将结果导出来手动删除不现实啊

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1楼 2013-09-29 10:47:53

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lccbat

金虫 (初入文坛)

应助: 5 (幼儿园)
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虫号: 806940
注册: 2009-07-11
专业: 理论和计算化学

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

ligprep会对每一个分子产生多个构象，glide会认为这是不同的分子，可以写一个小程序提取最优构象。

或者，在ligprep中不生成多个构象，在glide中设定每一个分子只输出一个结果，这样，每个分子就只有一个最优结果了。

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2楼2013-10-02 00:30:39

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