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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » [求助]如何确定细菌的纲、门、属
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haoran930

银虫 (小有名气)

[交流] [求助]如何确定细菌的纲、门、属

请问：我测序结果知道后，用序列在NCBI上比对后发现，和它相似度大于95%的序列都是uncultured bacterium，请问我怎么来确定它是那个纲，那个门的菌呢？
因为不是微生物专业，还需要专业人士指点迷津？
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1楼 2007-11-27 16:43:57
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haoran930

银虫 (小有名气)
我看别人的文章，看见也是uncultured bacterium，却确定是什么门了，不知道怎么推断的？专业人士给指点一下迷津，谢谢了！
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5楼2007-11-27 20:07:50
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vicarner

金虫 (正式写手)
NCBI上面，比对结束后，不是有一个分类的选项吗？
把序列发过来，偶去比比看！
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2楼2007-11-27 17:50:29
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syyou

金虫 (小有名气)
呵呵，你运气真不好。对比出来的序列是这个结果那么就是说你的菌所属的菌属现在还没有真正确定，有待进一步的研究。。。
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3楼2007-11-27 18:02:57
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haoran930

银虫 (小有名气)
>Y-2
GCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGGCTAGAATGCTGGTAGACCGAGGG
TGAAAGCTCTCTTCCCCGCAAGGGGCTGCCGGTAAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTT
AAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCCATCACTAGTTGCCATCAGGTAATGCTGGGAACTCTAGTGAAACTGCCGTCGCAAG
ACGCGAGGAAGGAGGGGATGATGTCAAGTCATCATGGCCTTTATGCCCAGGGCTACACACGTGCTACAATGGAGAGGACA
AAGGGCTGCCACACGGCGACGTGGAGCTAATCCCAAAAACCTCTTCTCAGTTCAGATTGCAGTCTGCAACTCGACTGCAT
GAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGTATATCAGCAATGATACGGTGAATACGTTCCCGGGC
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4楼2007-11-27 19:55:15
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