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doradl

新虫 (初入文坛)

[求助] castrp计算出错,不知什么原因,求大神解答

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|                                                 |
|      CCC   AA    SSS  TTTTT  EEEEE  PPPP        |
|     C     A  A  S       T    E      P   P       |
|     C     AAAA   SS     T    EEE    PPPP        |
|     C     A  A     S    T    E      P           |
|      CCC  A  A  SSS     T    EEEEE  P           |
|                                                 |
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| Welcome to Materials Studio CASTEP version 5.0  |
| Ab Initio Total Energy Program                  |
|                                                 |
| Authors:                                        |
| M. Segall, M. Probert, C. Pickard, P. Hasnip,   |
| S. Clark, K. Refson, M. Payne                   |
|                                                 |
| Contributors:                                   |
| P. Lindan, P. Haynes, J. White, V. Milman,      |
| N. Govind, M. Gibson, P. Tulip, V. Cocula,      |
| B. Montanari, D. Quigley, M. Glover,            |
| L. Bernasconi, A. Perlov, M. Plummer,           |
| E. McNellis, J. Meyer                           |
|                                                 |
| Copyright (c) 2000 - 2009                       |
|                                                 |
| Please cite                                     |
|                                                 |
|     "First principles methods using CASTEP"     |
|                                                 |
|         Zeitschrift fuer Kristallographie       |
|           220(5-6) pp. 567-570 (2005)           |
|                                                 |
| S. J. Clark, M. D. Segall, C. J. Pickard,       |
| P. J. Hasnip, M. J. Probert, K. Refson,         |
| M. C. Payne                                     |
|                                                 |
|       in all publications arising from          |
|              your use of CASTEP                 |
|                                                 |
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This version was compiled for i686-windows-msvc2008 on Oct 22 2009

License checkout of MS_castep successful


Pseudo atomic calculation performed for Li 1s2 2s1

Converged in 17 iterations to a total energy of -188.0228 eV


Pseudo atomic calculation performed for O 2s2 2p4

Converged in 23 iterations to a total energy of -429.2136 eV


Pseudo atomic calculation performed for P 3s2 3p3

Converged in 12 iterations to a total energy of -174.1997 eV


Pseudo atomic calculation performed for V 3s2 3p6 3d3 4s2

Converged in 36 iterations to a total energy of -1967.6886 eV

Calculation parallelised over    1 nodes.
K-points are distributed over    1 groups, each containing    1 nodes.

************************************ Title ************************************
CASTEP calculation from Materials Studio

***************************** General Parameters ******************************
  
output verbosity                               : normal  (1)
write checkpoint data to                       : LVP5.check
type of calculation                            : single point energy
stress calculation                             : off
density difference calculation                 : off
electron localisation func (ELF) calculation   : off
Hirshfeld analysis                             : off
unlimited duration calculation
timing information                             : on
memory usage estimate                          : on
write final potential to formatted file        : off
write final density to formatted file          : off
  
output         length unit                     : A
output           mass unit                     : amu
output           time unit                     : ps
output         charge unit                     : e
output         energy unit                     : eV
output          force unit                     : eV/A
output       velocity unit                     : A/ps
output       pressure unit                     : GPa
output     inv_length unit                     : 1/A
output      frequency unit                     : cm-1
output force constant unit                     : eV/A**2
output         volume unit                     : A**3
output   IR intensity unit                     : (D/A)**2/amu
output         dipole unit                     : D
output         efield unit                     : eV/A/e
  
wavefunctions paging                           : none
random number generator seed                   : randomised (101959799)
data distribution                              : optimal for this architecture
optimization strategy                          : balance speed and memory

*********************** Exchange-Correlation Parameters ***********************
  
using functional                               : Perdew Burke Ernzerhof
Divergence correction                          : off
DFT+D: Semi-empirical dispersion correction    : off

************************* Pseudopotential Parameters **************************
  
pseudopotential representation                 : reciprocal space
<beta|phi> representation                      : reciprocal space

**************************** Basis Set Parameters *****************************
  
basis set accuracy                             : MEDIUM
plane wave basis set cut-off                   :   300.0000   eV
size of standard grid                          :     1.7500
largest prime factor in FFT                    :          5
finite basis set correction                    : none

**************************** Electronic Parameters ****************************
  
number of  electrons                           :  488.0   
net charge of system                           :  0.000   
net spin   of system                           :  0.000   
number of  up  spins                           :  244.0   
number of down spins                           :  244.0   
treating system as non-spin-polarized
number of bands                                :        293

********************* Electronic Minimization Parameters **********************
  
Method: Treating system as metallic with density mixing treatment of electrons,
         and number of  SD  steps               :          1
         and number of  CG  steps               :          4
  
total energy / atom convergence tol.           : 0.2000E-05   eV
eigen-energy convergence tolerance             : 0.5461E-06   eV
max force / atom convergence tol.              : ignored
convergence tolerance window                   :          3   cycles
max. number of SCF cycles                      :        200
number of fixed-spin iterations                :         10
smearing scheme                                : Gaussian
smearing width                                 : 0.1000       eV
Fermi energy convergence tolerance             : 0.5461E-07   eV

************************** Density Mixing Parameters **************************
  
density-mixing scheme                          : Pulay
max. length of mixing history                  :         20
charge density mixing amplitude                : 0.5000   
charge density mixing g-vector                 :  1.500       1/A

*******************************************************************************
  

                           -------------------------------
                                      Unit Cell
                           -------------------------------
        Real Lattice(A)                      Reciprocal Lattice(1/A)
   8.6051139   0.0000000  -0.0914677        0.7301688   0.0000000   0.0000000
   0.0000000   8.5917000   0.0000000        0.0000000   0.7313087   0.0000000
   0.0000000   0.0000000  12.0370000        0.0055485   0.0000000   0.5219893

                       Lattice parameters(A)       Cell Angles
                    a =    8.605600          alpha =   90.000000
                    b =    8.591700          beta  =   90.609000
                    c =   12.037000          gamma =   90.000000

                       Current cell volume =  889.926189       A**3

                           -------------------------------
                                     Cell Contents
                           -------------------------------
                         Total number of ions in cell =   80
                      Total number of species in cell =    4
                        Max number of any one species =   48

            xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
            x  Element    Atom        Fractional coordinates of atoms  x
            x            Number           u          v          w      x
            x----------------------------------------------------------x
            x  Li           1         0.202000   0.781000   0.182000   x
            x  Li           2         0.934000   0.312000   0.226000   x
            x  Li           3         0.576000   0.429000   0.207000   x
            x  Li           4        -0.202000   1.281000   0.318000   x
            x  Li           5        -0.934000   0.812000   0.274000   x
            x  Li           6        -0.576000   0.929000   0.293000   x
            x  Li           7        -0.202000  -0.781000  -0.182000   x
            x  Li           8        -0.934000  -0.312000  -0.226000   x
            x  Li           9        -0.576000  -0.429000  -0.207000   x
            x  Li          10         0.202000  -0.281000   0.682000   x
            x  Li          11         0.934000   0.188000   0.726000   x
            x  Li          12         0.576000   0.071000   0.707000   x
            x  O            1         0.927600   0.116300   0.146300   x
            x  O            2         0.148200   0.976900   0.240400   x
            x  O            3         0.172700   0.051600   0.034600   x
            x  O            4         0.161800   0.260900   0.184500   x
            x  O            5         0.422900   0.091200   0.326700   x
            x  O            6         0.695900   0.004500   0.284100   x
            x  O            7         0.641600   0.087600   0.477200   x
            x  O            8         0.643700   0.293300   0.314300   x
            x  O            9         0.950900   0.128400   0.569500   x
            x  O           10         0.930700   0.319400   0.402800   x
            x  O           11         0.172500   0.163000   0.431400   x
            x  O           12         0.105900   0.366200   0.576100   x
            x  O           13        -0.927600   0.616300   0.353700   x
            x  O           14        -0.148200   1.476900   0.259600   x
            x  O           15        -0.172700   0.551600   0.465400   x
            x  O           16        -0.161800   0.760900   0.315500   x
            x  O           17        -0.422900   0.591200   0.173300   x
            x  O           18        -0.695900   0.504500   0.215900   x
            x  O           19        -0.641600   0.587600   0.022800   x
            x  O           20        -0.643700   0.793300   0.185700   x
            x  O           21        -0.950900   0.628400  -0.069500   x
            x  O           22        -0.930700   0.819400   0.097200   x
            x  O           23        -0.172500   0.663000   0.068600   x
            x  O           24        -0.105900   0.866200  -0.076100   x
            x  O           25        -0.927600  -0.116300  -0.146300   x
            x  O           26        -0.148200  -0.976900  -0.240400   x
            x  O           27        -0.172700  -0.051600  -0.034600   x
            x  O           28        -0.161800  -0.260900  -0.184500   x
            x  O           29        -0.422900  -0.091200  -0.326700   x
            x  O           30        -0.695900  -0.004500  -0.284100   x
            x  O           31        -0.641600  -0.087600  -0.477200   x
            x  O           32        -0.643700  -0.293300  -0.314300   x
            x  O           33        -0.950900  -0.128400  -0.569500   x
            x  O           34        -0.930700  -0.319400  -0.402800   x
            x  O           35        -0.172500  -0.163000  -0.431400   x
            x  O           36        -0.105900  -0.366200  -0.576100   x
            x  O           37         0.927600   0.383700   0.646300   x
            x  O           38         0.148200  -0.476900   0.740400   x
            x  O           39         0.172700   0.448400   0.534600   x
            x  O           40         0.161800   0.239100   0.684500   x
            x  O           41         0.422900   0.408800   0.826700   x
            x  O           42         0.695900   0.495500   0.784100   x
            x  O           43         0.641600   0.412400   0.977200   x
            x  O           44         0.643700   0.206700   0.814300   x
            x  O           45         0.950900   0.371600   1.069500   x
            x  O           46         0.930700   0.180600   0.902800   x
            x  O           47         0.172500   0.337000   0.931400   x
            x  O           48         0.105900   0.133800   1.076100   x
            x  P            1         0.106900   0.099600   0.158600   x
            x  P            2         0.607800   0.114900   0.355200   x
            x  P            3         0.039500   0.250900   0.488500   x
            x  P            4        -0.106900   0.599600   0.341400   x
            x  P            5        -0.607800   0.614900   0.144800   x
            x  P            6        -0.039500   0.750900   0.011500   x
            x  P            7        -0.106900  -0.099600  -0.158600   x
            x  P            8        -0.607800  -0.114900  -0.355200   x
            x  P            9        -0.039500  -0.250900  -0.488500   x
            x  P           10         0.106900   0.400400   0.658600   x
            x  P           11         0.607800   0.385100   0.855200   x
            x  P           12         0.039500   0.249100   0.988500   x
            x  V            1         0.251030   0.459350   0.109360   x
            x  V            2         0.753070   0.474510   0.390380   x
            x  V            3        -0.251030   0.959350   0.390640   x
            x  V            4        -0.753070   0.974510   0.109620   x
            x  V            5        -0.251030  -0.459350  -0.109360   x
            x  V            6        -0.753070  -0.474510  -0.390380   x
            x  V            7         0.251030   0.040650   0.609360   x
            x  V            8         0.753070   0.025490   0.890380   x
            xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx


                         No user defined ionic velocities

                           -------------------------------
                                   Details of Species
                           -------------------------------

                               Mass of species in AMU
                                    Li    6.9400001
                                    O   15.9989996
                                    P   30.9740009
                                    V   50.9410019

                          Electric Quadrupole Moment (Barn)
                                    Li   -0.0401000 Isotope  7
                                    O   -0.0255800 Isotope 17
                                    P    1.0000000 No Isotope Defined
                                    V   -0.0520000 Isotope 51

                          Files used for pseudopotentials:
                                    Li Li_00PBE.usp
                                    O O_00PBE.usp
                                    P P_00PBE.usp
                                    V V_00PBE.usp

                           -------------------------------
                              k-Points For BZ Sampling
                           -------------------------------
                       MP grid size for SCF calculation is  1  1  1
                         Number of kpoints used =           1

             +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
             +  Number       Fractional coordinates        Weight  +
             +-----------------------------------------------------+
             +     1   0.000000   0.000000   0.000000   1.0000000  +
             +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++

                           -------------------------------
                               Symmetry and Constraints
                           -------------------------------

                      Number of symmetry operations   =           4
         There are no ionic constraints specified or generated for this cell
                      Maximum deviation from symmetry = 0.267275E-14     ANG
               Point group of crystal =     5: C2h, 2/m, 2/m
           Set iprint > 1 for details on symmetry rotations/translations

                        Centre of mass is NOT constrained

                         Number of cell constraints= 2
                         Cell constraints are:  1 2 3 0 5 0

                         External pressure/stress (GPa)
                          0.00000   0.00000   0.00000
                                    0.00000   0.00000
                                              0.00000
  
+---------------- MEMORY AND SCRATCH DISK ESTIMATES PER NODE -----------------+
|                                                     Memory          Disk    |
| Model and support data                              182.5 MB       231.9 MB |
| Electronic energy minimisation requirements          84.2 MB        23.3 MB |
|                                               ----------------------------- |
| Approx. total storage required per node             266.7 MB       255.3 MB |
|                                                                             |
| Requirements will fluctuate during execution and may exceed these estimates |
+-----------------------------------------------------------------------------+
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
SCF loop      Energy           Fermi           Energy gain       Timer   <-- SCF
                               energy          per atom          (sec)   <-- SCF
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
Initial  -3.52710641E+004  5.62727949E+001                        24.54  <-- SCF
      1  -4.01308596E+004  5.69339021E+000   6.07474435E+001      78.45  <-- SCF
      2  -4.10503807E+004  4.25491473E+000   1.14940139E+001     130.76  <-- SCF
      3  -4.10816661E+004  4.19410677E+000   3.91068425E-001     176.03  <-- SCF
      4  -4.11798187E+004  3.40277493E+000   1.22690670E+000     228.03  <-- SCF
      5  -4.09801166E+004  6.16487790E+000  -2.49627601E+000     284.28  <-- SCF
      6  -4.09739773E+004  4.98393747E+000  -7.67413055E-002     336.17  <-- SCF
      7  -4.09721382E+004  5.29478646E+000  -2.29888202E-002     386.54  <-- SCF
      8  -4.09708929E+004  5.51801131E+000  -1.55665521E-002     436.24  <-- SCF
      9  -4.09696598E+004  5.46655451E+000  -1.54128879E-002     484.02  <-- SCF
     10  -4.09696643E+004  5.43260419E+000   5.60720150E-005     533.59  <-- SCF
     11  -4.09699564E+004  5.44222658E+000   3.65053974E-003     581.07  <-- SCF
     12  -4.09699167E+004  5.46585208E+000  -4.95974682E-004     630.95  <-- SCF
     13  -4.09698936E+004  5.45348585E+000  -2.88291328E-004     680.29  <-- SCF
     14  -4.09698653E+004  5.47399287E+000  -3.53903868E-004     728.31  <-- SCF
     15  -4.09699239E+004  5.47566957E+000   7.32005781E-004     777.06  <-- SCF
     16  -4.09699255E+004  5.47479411E+000   2.07364904E-005     814.96  <-- SCF
     17  -4.09699260E+004  5.47562512E+000   6.00940593E-006     850.25  <-- SCF
     18  -4.09699261E+004  5.47579614E+000   1.80021259E-006     884.42  <-- SCF
     19  -4.09699261E+004  5.47594611E+000   4.36185746E-008     916.86  <-- SCF
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF

Final energy, E             =  -40969.64061122     eV
Final free energy (E-TS)    =  -40969.92614674     eV
(energies not corrected for finite basis set)

NB est. 0K energy (E-0.5TS)      =  -40969.78337898     eV


Writing model to LVP5.check

***************** Symmetrised Forces *****************
*                                                    *
*            Cartesian components (eV/A)             *
* -------------------------------------------------- *
*                   x            y            z      *
*                                                    *
* Li        1     -7.63220     -4.34809      2.45975 *
* Li        2      3.09459     -0.80674     -3.07788 *
* Li        3      0.57025     -5.56415      0.63759 *
* Li        4      7.63220     -4.34809     -2.45975 *
* Li        5     -3.09459     -0.80674      3.07788 *
* Li        6     -0.57025     -5.56415     -0.63759 *
* Li        7      7.63220      4.34809     -2.45975 *
* Li        8     -3.09459      0.80674      3.07788 *
* Li        9     -0.57025      5.56415     -0.63759 *
* Li       10     -7.63220      4.34809      2.45975 *
* Li       11      3.09459      0.80674     -3.07788 *
* Li       12      0.57025      5.56415      0.63759 *
* O         1     -4.51247     -2.07459      5.73171 *
* O         2      1.14181     -0.80051      6.80933 *
* O         3      5.46777     -4.74818    -63.81797 *
* O         4      3.48669      5.49940      6.90284 *
* O         5      5.21051      5.21966      1.57020 *
* O         6     -7.01965      4.61799    -25.86182 *
* O         7     -0.70397      1.49375      1.56363 *
* O         8     -9.83514     -3.42122      0.36916 *
* O         9      2.06510      1.89081     -3.20301 *
* O        10      1.99384      0.76501      2.19787 *
* O        11     -0.90459      2.92160      2.41027 *
* O        12    -23.88591    -51.33326    -79.99507 *
* O        13      4.51247     -2.07459     -5.73171 *
* O        14     -1.14181     -0.80051     -6.80933 *
* O        15     -5.46777     -4.74818     63.81797 *
* O        16     -3.48669      5.49940     -6.90284 *
* O        17     -5.21051      5.21966     -1.57020 *
* O        18      7.01965      4.61799     25.86182 *
* O        19      0.70397      1.49375     -1.56363 *
* O        20      9.83514     -3.42122     -0.36916 *
* O        21     -2.06510      1.89081      3.20301 *
* O        22     -1.99384      0.76501     -2.19787 *
* O        23      0.90459      2.92160     -2.41027 *
* O        24     23.88591    -51.33326     79.99507 *
* O        25      4.51247      2.07459     -5.73171 *
* O        26     -1.14181      0.80051     -6.80933 *
* O        27     -5.46777      4.74818     63.81797 *
* O        28     -3.48669     -5.49940     -6.90284 *
* O        29     -5.21051     -5.21966     -1.57020 *
* O        30      7.01965     -4.61799     25.86182 *
* O        31      0.70397     -1.49375     -1.56363 *
* O        32      9.83514      3.42122     -0.36916 *
* O        33     -2.06510     -1.89081      3.20301 *
* O        34     -1.99384     -0.76501     -2.19787 *
* O        35      0.90459     -2.92160     -2.41027 *
* O        36     23.88591     51.33326     79.99507 *
* O        37     -4.51247      2.07459      5.73171 *
* O        38      1.14181      0.80051      6.80933 *
* O        39      5.46777      4.74818    -63.81797 *
* O        40      3.48669     -5.49940      6.90284 *
* O        41      5.21051     -5.21966      1.57020 *
* O        42     -7.01965     -4.61799    -25.86182 *
* O        43     -0.70397     -1.49375      1.56363 *
* O        44     -9.83514      3.42122      0.36916 *
* O        45      2.06510     -1.89081     -3.20301 *
* O        46      1.99384     -0.76501      2.19787 *
* O        47     -0.90459     -2.92160      2.41027 *
* O        48    -23.88591     51.33326    -79.99507 *
* P         1    -15.18440    -12.28534    100.61612 *
* P         2    -16.77969     14.39766     -2.88950 *
* P         3     -5.14216    -15.60627     -3.64102 *
* P         4     15.18440    -12.28534   -100.61612 *
* P         5     16.77969     14.39766      2.88950 *
* P         6      5.14216    -15.60627      3.64102 *
* P         7     15.18440     12.28534   -100.61612 *
* P         8     16.77969    -14.39766      2.88950 *
* P         9      5.14216     15.60627      3.64102 *
* P        10    -15.18440     12.28534    100.61612 *
* P        11    -16.77969    -14.39766     -2.88950 *
* P        12     -5.14216     15.60627     -3.64102 *
* V         1    -19.99392    -18.90235    -26.04345 *
* V         2    -41.04174    -37.64317    -26.31113 *
* V         3     19.99392    -18.90235     26.04345 *
* V         4     41.04174    -37.64317     26.31113 *
* V         5     19.99392     18.90235     26.04345 *
* V         6     41.04174     37.64317     26.31113 *
* V         7    -19.99392     18.90235    -26.04345 *
* V         8    -41.04174     37.64317    -26.31113 *
*                                                    *
******************************************************

Writing model to LVP5.check

Writing analysis data to LVP5.castep_bin
Initialisation time =      3.76 s
Calculation time    =    964.15 s
Finalisation time   =      0.66 s
Total time          =    968.56 s
我的出错文件是这样,不知道是什么愿意,求帮助。
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souledge

专家顾问 (著名写手)

★ ★
identation: 金币+2, 谢谢回帖交流,中秋节快乐! 2013-09-19 10:48:11
至少这个文件的信息是,计算完成,没有出错……
思想重于技巧,内涵重于表象
4楼2013-09-18 11:21:07
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普通回帖

怒冲星河

木虫 (正式写手)

不知楼主算的什么性质
2楼2013-09-18 11:05:10
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doradl

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 怒冲星河 at 2013-09-18 11:05:10
不知楼主算的什么性质

只是算能带和态密度。
3楼2013-09-18 11:11:36
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怒冲星河

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by souledge at 2013-09-18 11:21:07
至少这个文件的信息是,计算完成,没有出错……

同意
5楼2013-09-18 11:27:15
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doradl

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by souledge at 2013-09-18 11:21:07
至少这个文件的信息是,计算完成,没有出错……

计算完了之后会出现这么一个对话框,the job has failed.download any results generated so far?点YES后就出现上面那个文件。
6楼2013-09-18 13:11:54
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doradl

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by souledge at 2013-09-18 11:21:07
至少这个文件的信息是,计算完成,没有出错……

还有就是收敛问题,这个怎么知道收敛不收敛啊。
7楼2013-09-18 13:13:45
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souledge

专家顾问 (著名写手)

★ ★ ★
identation: 金币+3, 谢谢回帖交流,中秋节快乐! 2013-09-19 10:48:32
引用回帖:
6楼: Originally posted by doradl at 2013-09-18 13:11:54
计算完了之后会出现这么一个对话框,the job has failed.download any results generated so far?点YES后就出现上面那个文件。...

1,给出的*.castep文件其实仅仅是总能计算(SCF)的结果文件,所以这一步没有问题,不代表Band Structure和DOS的计算没有问题;
2,LZ的模型很大,虽然在做SCF时没有什么问题,但是对于NSCF的计算,可能会有内存不足。而且,LZ只使用Gamma点进行了自洽计算,在非自洽时不保证所有K点都能很好的求解,虽然CASTEP的确基本不出现对角化错误的毛病(出了错也好像不这么显示的样子)。
思想重于技巧,内涵重于表象
8楼2013-09-18 13:29:19
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doradl

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by souledge at 2013-09-18 13:29:19
1,给出的*.castep文件其实仅仅是总能计算(SCF)的结果文件,所以这一步没有问题,不代表Band Structure和DOS的计算没有问题;
2,LZ的模型很大,虽然在做SCF时没有什么问题,但是对于NSCF的计算,可能会有内存不 ...

那要怎么解决啊,我也是才接触这个软件,不怎么懂。
9楼2013-09-18 14:07:25
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怒冲星河

木虫 (正式写手)

你看一下其他*.castep文件是怎么样的,比如说*DOS.castep
10楼2013-09-18 19:52:20
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