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血的教训_关于pseudo=read
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不知道咱们这里是怎么做过渡金属的,我是刚入手,所以犯了很多低级错误,在这里说一下 ,大家随便BS,关键是防着后面有人犯同样的错误,hoho 我现在做的是Pt的体系,cis-Cl2-Pt-R2,两个Cl原子处于cis-位置,但是我刚开始的时候,画分子时很粗心的把cis画成了trans结构,开始尝试做计算。。。。然后,当天晚些时候,重新检查分子结构,发现图画错了,于是改正,同时同组里面的同学告诉我做过渡金属,一般需要在路径部分输入“pseudo=read", 问他们是什么作用,他们也说的不是很清楚,反正有用,我就加了。 但是今天无聊的时候用"SCF D",检查两个log文件发现,能量相差了 2000 hartree !!!! 后来请教老师,发现输出部分有如下不同: 未加入”pseudo=read"时, 178 alpha electrons 178 beta electrons 加入 "pseudo=read" 时, 128 alpha electrons 128 beta electrons 也就是在用了"pseudo=read"关键字以后,电子数少了整整100个。后来老师帮我分析了这个原因:pseudo=read, 是一个对赝势场的定义(具体定义什么的详见gaussian手册),我只说直观的,加入这个关键字以后,饱和壳层的原子不再纳入考虑,把它们当做是核的一部分处理 。而不加这个关键字,计算的是全电子结构,所有的电子波函数都参与一次计算。简单的说,对于我做的体系,含有一个Pt原子,两个P原子,两个Cl原子。对于Pt而言,不加pseudo=read时,有78个电子,加时是18个电子(只算外层的,价电子),Cl,不加时17电子,加7电子;P分别是15和5,刚好(60+10*2+10*2)=100个电子。 总而言之,在加 "pseudo=read" 之后,整个分子的能量大大降低,但这种降低并非真实情况。所以我们在做有关于过渡金属的时候,一定要加这个关键字。 现学现卖,说的比较粗俗,希望大家能够看懂。 |
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