24小时热门版块排行榜    

查看: 870  |  回复: 1

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

[求助] 【已经解决,编译出的问题】DAY3_water_inp1计算出错

势文件路径是对的。会不会是编译方面的问题?
输入文件:
CODE:
&CPMD
  OPTIMIZE WAVEFUNCTION
  STRUCTURE BONDS ANGLES
  RHOOUT
&END

&DFT
  FUNCTIONAL PBE
&END

&SYSTEM
  SYMMETRY
  1
  CELL
  15.0000  1.0  1.0  0  0  0
  CUTOFF
  70.0
&END

&ATOMS
*O_MT_PBE.psp  KLEINMAN-BYLANDER
   LMAX=P
   1
     0.0000 -0.1267  0.0000
*H_MT_PBE.psp
   LMAX=S
   2
     0.0000  1.0058  1.4524
     0.0000  1.0058 -1.4524
&END

输出文件:
CODE:
PROGRAM CPMD STARTED AT: Sat Aug 31 12:00:25 2013  
SETCNST| USING: CODATA 2006 UNITS


               ******  ******    ****  ****  ******   
              *******  *******   **********  *******  
             ***       **   ***  ** **** **  **   ***
             **        **   ***  **  **  **  **    **
             **        *******   **      **  **    **
             ***       ******    **      **  **   ***
              *******  **        **      **  *******  
               ******  **        **      **  ******   

                          VERSION 3.13.2

                            COPYRIGHT
                      IBM RESEARCH DIVISION
                MPI FESTKOERPERFORSCHUNG STUTTGART

                       The CPMD consortium
                  Home Page: http://www.cpmd.org
               Mailing List: cpmd-list@cpmd.org
                     E-mail: cpmd@cpmd.org


                  ***  Jun  5 2013 -- 09:59:13  ***

THE INPUT FILE IS:                                          inp1
THIS JOB RUNS ON:                                         gg0110
THE CURRENT DIRECTORY IS:
                  /home-gg/users/nscc410_CWL/cpmd_work/DAY3/water
THE TEMPORARY DIRECTORY IS:
                  /home-gg/users/nscc410_CWL/cpmd_work/DAY3/water
THE PROCESS ID IS:                                         12657
THE JOB WAS SUBMITTED BY:                             nscc410_CW


SINGLE POINT DENSITY OPTIMIZATION

PATH TO THE RESTART FILES:                                    ./
GRAM-SCHMIDT ORTHOGONALIZATION
MAXIMUM NUMBER OF STEPS:                             10000 STEPS
MAXIMUM NUMBER OF ITERATIONS FOR SC:                 10000 STEPS
PRINT INTERMEDIATE RESULTS EVERY                     10001 STEPS
STORE INTERMEDIATE RESULTS EVERY                     10001 STEPS
NUMBER OF DISTINCT RESTART FILES:                              1
TEMPERATURE IS CALCULATED ASSUMING EXTENDED BULK BEHAVIOR
STORE ELECTRON DENSITY AT THE END OF THE RUN
FICTITIOUS ELECTRON MASS:                               400.0000
TIME STEP FOR ELECTRONS:                                  5.0000
TIME STEP FOR IONS:                                       5.0000
CONVERGENCE CRITERIA FOR WAVEFUNCTION OPTIMIZATION:   1.0000E-05
WAVEFUNCTION OPTIMIZATION BY PRECONDITIONED DIIS
THRESHOLD FOR THE WF-HESSIAN IS                           0.5000
MAXIMUM NUMBER OF VECTORS RETAINED FOR DIIS:                  10
STEPS UNTIL DIIS RESET ON POOR PROGRESS:                      10
FULL ELECTRONIC GRADIENT IS USED
SPLINE INTERPOLATION IN G-SPACE FOR PSEUDOPOTENTIAL FUNCTIONS
    NUMBER OF SPLINE POINTS:                                 5000

EXCHANGE CORRELATION FUNCTIONALS
    LDA EXCHANGE:                                            NONE
    LDA XC THROUGH PADE APPROXIMATION
    S.GOEDECKER, J.HUTTER, M.TETER PRB 54 1703 (1996)
    GRADIENT CORRECTED FUNCTIONAL
    DENSITY THRESHOLD:                                1.00000E-08
    EXCHANGE ENERGY
       [PBE: J.P. PERDEW ET AL. PRL 77, 3865 (1996)]
    CORRELATION ENERGY
       [PBE: J.P. PERDEW ET AL. PRL 77, 3865 (1996)]

***     DETSP| SIZE OF THE PROGRAM IS   12588/ 319884 kBYTES ***

***************************** ATOMS ****************************
   NR   TYPE        X(bohr)        Y(bohr)        Z(bohr)     MBL
    1      O       0.000000      -0.126700       0.000000       3
    2      H       0.000000       1.005800       1.452400       3
    3      H       0.000000       1.005800      -1.452400       3
****************************************************************

NUMBER OF STATES:                                              4
NUMBER OF ELECTRONS:                                     8.00000
CHARGE:                                                  0.00000
ELECTRON TEMPERATURE(KELVIN):                            0.00000
OCCUPATION
  2.0  2.0  2.0  2.0

    ============================================================  
    |    Pseudopotential Report                                |  
    ------------------------------------------------------------  
    |  Atomic Symbol                   :   O                   |  
    |  Atomic Number                   :   8                   |  
    |  Number of core states           :   1                   |  
    |  Number of valence states        :   2                   |  
    |  Exchange-Correlation Functional :                       |  
    |     Slater exchange :  0.6667                            |  
    |     LDA correlation : Ceperley-Alder                     |  
    |     Exchange GC     : Perdew-Burke-Ernzerhof             |  
    |     Correlation GC  : Perdew-Burke-Ernzerhof             |  
    |  Electron Configuration :   N   L  Occupation            |  
    |                             1   S    2.0000              |  
    |                             2   S    2.0000              |  
    |                             2   P    4.0000              |  
    |  Full Potential Total Energy =      -74.943856           |  
    |  Trouiller-Martins normconserving PP                     |  
    |     n    l        rc       energy                        |  
    |     2    S    1.1200     -0.87882                        |  
    |     2    P    1.1200     -0.33215                        |  
    |     3    D    1.1200     -0.33215                        |  
    |  Number of Mesh Points :   631                           |  
    |  Pseudoatom Total Energy =  -15.770807                   |  
    ============================================================  

    ============================================================  
    |    Pseudopotential Report     Fri Feb 20 19:18:54 1998   |  
    ------------------------------------------------------------  
    |  Atomic Symbol                   :   H                   |  
    |  Atomic Number                   :   1                   |  
    |  Number of core states           :   0                   |  
    |  Number of valence states        :   1                   |  
    |  Exchange-Correlation Functional :                       |  
    |     Slater exchange :   .6667                            |  
    |     LDA correlation : Ceperley-Alder                     |  
    |     Exchange GC     : Perdew-Burke-Ernzerhof             |  
    |     Correlation GC  : Perdew-Burke-Ernzerhof             |  
    |  Electron Configuration :   N   L  Occupation            |  
    |                             1   S     .7000              |  
    |  Full Potential Total Energy     -.474341                |  
    |  Trouiller-Martins normconserving PP                     |  
    |     n    l        rc       energy                        |  
    |     1    S     .5000      -.37203                        |  
    |     2    P     .3828      -.37203                        |  
    |  Number of Mesh Points :   511                           |  
    |  Pseudoatom Total Energy    -.367794                     |  
    ============================================================  

****************************************************************
*   ATOM       MASS   RAGGIO NLCC              PSEUDOPOTENTIAL *
*      O    15.9994   1.2000  NO     KLEINMAN      S  NONLOCAL *
*                                                  P     LOCAL *
*      H     1.0080   1.2000  NO                   S     LOCAL *
****************************************************************


PARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARA
  NCPU     NGW     NHG  PLANES  GXRAYS  HXRAYS ORBITALS Z-PLANES
     0   16686  133590      80    1245    5005       4       1
                G=0 COMPONENT ON PROCESSOR :     0
PARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARAPARA

***    LOADPA| SIZE OF THE PROGRAM IS   19488/ 327236 kBYTES ***

OPENMPOPENMPOPENMPOPENMPOPENMPOPENMPOPENMPOPENMPOPENMPOPENMPOPEN
NUMBER OF CPUS PER TASK                                        1
OPENMPOPENMPOPENMPOPENMPOPENMPOPENMPOPENMPOPENMPOPENMPOPENMPOPEN

***     RGGEN| SIZE OF THE PROGRAM IS   22104/ 329844 kBYTES ***

************************** SUPERCELL ***************************
SYMMETRY:                                           SIMPLE CUBIC
LATTICE CONSTANT(a.u.):                                 15.00000
CELL DIMENSION:  15.0000  1.0000  1.0000  0.0000  0.0000  0.0000
VOLUME(OMEGA IN BOHR^3):                              3375.00000
LATTICE VECTOR A1(BOHR):           15.0000     0.0000     0.0000
LATTICE VECTOR A2(BOHR):            0.0000    15.0000     0.0000
LATTICE VECTOR A3(BOHR):            0.0000     0.0000    15.0000
RECIP. LAT. VEC. B1(2Pi/BOHR):      0.0667     0.0000     0.0000
RECIP. LAT. VEC. B2(2Pi/BOHR):      0.0000     0.0667     0.0000
RECIP. LAT. VEC. B3(2Pi/BOHR):      0.0000     0.0000     0.0667
REAL SPACE MESH:                    80           80           80
WAVEFUNCTION CUTOFF(RYDBERG):                           70.00000
DENSITY CUTOFF(RYDBERG):          (DUAL= 4.00)         280.00000
NUMBER OF PLANE WAVES FOR WAVEFUNCTION CUTOFF:             16686
NUMBER OF PLANE WAVES FOR DENSITY CUTOFF:                 133590
****************************************************************

***  RINFORCE| SIZE OF THE PROGRAM IS   28092/ 336616 kBYTES ***
***    FFTPRP| SIZE OF THE PROGRAM IS   44724/ 353224 kBYTES ***

GENERATE ATOMIC BASIS SET
      O        SLATER ORBITALS
        2S        ALPHA=   2.2458      OCCUPATION= 2.00
        2P        ALPHA=   2.2266      OCCUPATION= 4.00
      H        SLATER ORBITALS
        1S        ALPHA=   1.0000      OCCUPATION= 1.00


INITIALIZATION TIME:                                0.38 SECONDS

***    WFOPTS| SIZE OF THE PROGRAM IS   48488/ 375928 kBYTES ***
***     PHFAC| SIZE OF THE PROGRAM IS   48644/ 412016 kBYTES ***
***    ATOMWF| SIZE OF THE PROGRAM IS   50476/ 414624 kBYTES ***


PROGRAM STOPS IN SUBROUTINE SCRPTR| RHOG |SCRATCH SPACE NOT FOUND                                                                        [PROC=   0]

屏幕输出信息:
DAY3/water> cpmd.x inp1 > out1
--------------------------------------------------------------------------
MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD
with errorcode 999.

NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.
You may or may not see output from other processes, depending on
exactly when Open MPI kills them.
--------------------------------------------------------------------------

[ Last edited by cenwanglai on 2013-9-1 at 15:58 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

找到问题了,我编译出错~
2楼2013-09-01 08:24:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cenwanglai 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 EZ67DG6CvcKL 2026-08-31 3/150 2026-08-31 22:23 by o3EMxHUAQDtS
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-31 21:30 by xiangy672
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
请填处理意见