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english6

金虫 (小有名气)

屌丝实验员

[交流] 差序列的时候碰到[gap 100 bp] Expand Ns 已有1人参与

在NCBI中查基因序列发现在序列中有个[gap 100 bp]    Expand Ns,什么意思?我要是设计引物扩增基因的话还考虑他们么?还是需要避开?
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... ;amp;report=genbank
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english6

金虫 (小有名气)

屌丝实验员

引用回帖:
4楼: Originally posted by gaoyang636 at 2013-09-02 11:14:49
我能打开了。
这里就是测序中的gap,未能成功测序或者搭建的序列。
你设计引物的时候就不能再gap区设计引物,应该要避开它。如果是对目的片段长度有要求,这里也粗略的估计了大约有100bp的长度,你也得考虑进去。

嘿嘿,多谢了,你是大神,你一说未能成功测序的我就明白了,还是你见多识广。
我再弱弱的问下,有什么原因导致未能成功测序或者搭建,我刚做了几个其他的基因,然后测序,都能出来全长呢?你就科普下呗~~~
5楼2013-09-02 16:18:14
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gaoyang636

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
给的链接我访问不了,显示“Access Denied”
2楼2013-08-31 17:40:35
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english6

金虫 (小有名气)

屌丝实验员

引用回帖:
2楼: Originally posted by gaoyang636 at 2013-08-31 17:40:35
给的链接我访问不了,显示“Access Denied”

谢谢回复,我点了下能打开,我再发一下,辛苦了,亲
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... ;amp;report=genbank
3楼2013-09-02 08:00:18
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gaoyang636

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我能打开了。
这里就是测序中的gap,未能成功测序或者搭建的序列。
你设计引物的时候就不能再gap区设计引物,应该要避开它。如果是对目的片段长度有要求,这里也粗略的估计了大约有100bp的长度,你也得考虑进去。
4楼2013-09-02 11:14:49
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