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zyh945

银虫 (小有名气)

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虫号: 1514758
注册: 2011-11-29
专业: 微生物资源与分类学

[求助] Greengenes database的使用

有没有人用过这个16s rRNA的数据库呀？文献中是这么说的：
A representative genomic 16S rRNA gene sequence
of A. mobile NGAT was compared using NCBI BLAST
[5,6]  under  default  settings  (e.g.,  considering  only
the  high-scoring  segment  pairs  (HSPs)  from  the
best  250  hits)  with  the  most  recent  release  of  the
Greengenes  database  [7]  and  the  relative  frequen-
cies  of  taxa  and  keywords  (reduced  to  their  stem
[8])  were  determined,  weighted  by  BLAST  scores.
完全不知道怎么操作~求指点~谢谢~

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1楼 2013-08-22 09:38:57

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