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cinema1980

木虫 (职业作家)

[求助] 青基 11205061 基于新一代测序数据的非比对统计功效的研究 摘要

求助摘要的编号:
11205061
项目名称:
基于新一代测序数据的非比对统计功效的研究
项目类型:
青年科学基金项目
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日日新
1楼 2013-07-31 23:20:45
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ahwzc

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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cinema1980: 金币+50, 基金HEPI+1, ★★★★★最佳答案, 摘要已收到，谢谢！ 2013-08-03 12:30:15
转录因子结合位点的识别及基因水平转移的预测是目前生物学研究的核心问题。目前已有许多非比对统计方法来计算及用实验的方法来解决这两个问题。然而，在这些方法中，除过一些模拟研究以外，用统计值的统计功效方法来研究该问题尤其少，而统计分析的误差将影响到所构建演化树的可靠性。本项目将在基于非比对D2统计值的基础上展开以下研究。（1）建立背景序列为高阶马尔可夫过程的隐马尔可夫模型；通过Bernoulli分布建立一种转换模型来研究两种情况下统计功效的分布情况，并通过模拟给出两种理论结果和图解。（2）开发适用于NGS 数据比较的非比对方法并研究其统计功效，期望有个近似统计极值，其统计功效在序列长度趋于无穷大时快速接近于1。（3）通过研究统计值与演化距离的关系，构建演化树。该研究在同源序列分析、基因水平转移及系统演化树构造等领域具有一定的应用价值，可为生物学物种分类提供可靠的理论依据。
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2楼2013-08-03 10:24:43
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ahwzc

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

基于新一代测序数据的非比对统计功效的研究

负责人：刘雪梅 参与人：黄晓东, 谢汇章, 张玉霞, 燕晶, 周颖

金额：22万 申请时间：2012 学科代码：统计物理学与复杂系统(A050105) 项目批准号：11205061

申请单位：华南理工大学 研究类型：基础研究

关键词：非比对方法;隐马尔科夫模型;统计功效;模体
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3楼2013-08-03 10:25:11
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