| 查看: 1021 | 回复: 1 | |||
qianxiong铜虫 (小有名气)
|
[交流]
原子坐标单位除了nm，Angstrom外还有其他单位表示吗？ 一篇诡异的文献
|
|
早先看了一篇用 SIESTA 做氧化石墨烯量化计算的文献Modeling of Graphite Oxide，该文的Supporting File中有经过优化后不同氧化比率的原子坐标数据。为了更直观比较各个结构，于是将各坐标数据转换的GRO格式的坐标文件。问题就在这里出现了： 1）在GRO 中其坐标单位是nm，若直接复制做成的结构文件其原子间的距离远大正常的成键范围。 2）若将其视为Supporting file 的单位视为Angstrom，在转换成GRO是（除以10）则又造成各原子间的距离过小， 原本不该成键的原子链接成键。 3） 最后折衷，将Supporting file 中的数值除以4.5 后转换成GRO，才大致在一相对正常的范围内，而键长与其他文献中的对应数据相比还是有不少出入。 4） 该 Supporting file共有 18 个结构，我转换4，只有三个能“正常”成键，其中一个结构为C8(OH)8无法成键如图所示： 各位方家知道这是什么原因吗？ |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有5人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有7人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有6人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有6人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
qianxiong
铜虫 (小有名气)
- 应助: 14 (小学生)
- 金币: 1882.2
- 红花: 3
- 帖子: 75
- 在线: 110.5小时
- 虫号: 1641543
- 注册: 2012-02-25
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
2楼2013-07-26 01:12:25
