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做CNV分析遇到一批样本全染色体组变异
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最近对一批样本做了Affymetrix的GenomeWideSNP 6.0芯片实验，拿到数据做拷贝数分析，结果有相当一部分样本整个染色体组都是变异。看得是泪牛满面啊，这家伙可还活着呀！！同时也对芯片做了SNP分型，Call rate基本都在95%以上，且来自同一母细胞培养出来的子细胞，从分型来看都没啥问题，而拷贝数却有的正常有的出现这种整个染色体组异常，而且差的不是一点点啊 这是神马情况呀。。。。。。  strange plot.png [ Last edited by ch_sunshine on 2013-7-25 at 16:18 ] |
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