24小时热门版块排行榜    

查看: 1858  |  回复: 4

dlstella

银虫 (小有名气)

[求助] 【求助】关于半经验ZINDO方法的输入命令 已有1人参与

求问半经验方法ZINDO的输入命令是怎样的。想算一个杂多酸结构,作业交进去就死掉了,请大神帮忙解决问题。这是输入文件:
%chk=4.chk
%mem=1gb
%nproc=8
# opt=(noeigentest) ZINDO/1 freq

Title Card Required

-3 1
Mo                -1.98520000   -3.29370000    0.52210000
O                 -0.50430000   -2.32780000    1.89190000
Mo                -2.23550000   -0.97650000    2.31650000
Mo                 0.91090000   -1.58630000    3.39420000
Mo                 1.14590000   -3.76050000    1.71030000
O                 -3.65440000   -4.12780000   -0.14720000
O                 -3.35960000   -2.02440000    1.10200000
O                 -4.06180000   -0.35600000    2.77410000
O                  1.96930000   -3.22510000    3.39600000
O                  2.47110000   -5.19020000    2.08050000
O                  2.06330000   -1.41970000    5.00070000
O                 -0.26590000   -2.49550000    4.66780000
Mo                -1.25710000   -3.52560000    3.33340000
O                 -2.66740000   -2.23800000    3.75130000
O                 -2.43090000   -4.42680000    2.05620000
O                 -0.00340000   -4.92360000    2.78740000
O                 -1.88630000   -4.70920000    4.77380000
P                 -0.55550000   -1.24600000    0.48800000
Mo                -0.31010000    1.23610000    2.68140000
O                 -0.46730000    2.78650000    3.88390000
Mo                 0.24660000   -3.92000000   -1.31130000
O                  0.42390000   -5.47100000   -2.51050000
Mo                 2.44190000   -1.72480000   -0.73510000
O                  2.06690000   -3.34710000   -1.79590000
O                  0.71800000   -0.40750000   -0.41710000
Mo                 2.20740000    0.44660000    0.94660000
Mo                -0.89610000    1.12700000   -0.21160000
Mo                -0.64570000   -1.19140000   -2.00710000
O                 -0.08450000   -2.83920000   -2.90770000
O                  4.22570000   -2.43640000   -1.23430000
O                  3.69950000   -0.51740000    0.14040000
O                  3.81830000    1.33690000    1.68860000
O                  1.51030000    1.80740000    2.19570000
O                 -1.88220000    0.29270000   -1.68410000
O                 -1.82690000   -1.24830000   -3.59880000
O                 -2.23310000    2.51220000   -0.68660000
O                  0.13900000    2.15970000   -1.51470000
Mo                 1.48860000    0.78670000   -1.85160000
O                  2.47110000    1.76750000   -0.47470000
O                  2.73090000   -0.64170000   -2.34070000
O                  0.37740000   -0.04900000   -3.22540000
O                  2.31230000    1.93550000   -3.22020000
O                 -1.31990000   -4.80120000   -0.53880000
O                  1.04910000   -4.96680000    0.15000000
O                 -0.65740000    2.46530000    1.19990000
O                  0.49150000    0.19120000    4.14460000
O                 -1.89220000    0.49630000    3.56300000
O                  0.50790000   -2.49440000    0.01300000
O                  0.27570000   -0.34600000    1.67690000
O                  2.73870000   -2.90280000    0.85500000
O                  2.50680000   -0.75770000    2.51640000
O                 -2.44820000    0.53180000    0.96500000
O                 -2.13290000   -2.38690000   -1.29530000
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Gaussian

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2013-07-22 00:49:46
有两个问题。

1,gaussian的zindo没有Mo元素的参数。
2,zindo方法是用光谱参数拟合的,只能用来算平衡构型附近的电子激发能。结构和频率计算的结果是无法预知的,因此gaussian禁止用zindo做这种计算。

建议用mopac程序,既有最新的Mo元素参数,也能做半经验+CI级别的激发能计算。但是如果做激发态优化和频率的话,最好先问问作者能不能做。
http://openmopac.net/manual/features.html#meci
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
2楼2013-07-21 22:47:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dlstella

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by beefly at 2013-07-21 22:47:04
有两个问题。

1,gaussian的zindo没有Mo元素的参数。
2,zindo方法是用光谱参数拟合的,只能用来算平衡构型附近的电子激发能。结构和频率计算的结果是无法预知的,因此gaussian禁止用zindo做这种计算。

建议 ...

谢谢!但是我没有MOPAC这个程序,一直都是用GAUSSIAN算的,请问您我这个作业用GAUSSIAN里面什么方法或基组可以算呢?这是一个杂多酸结构,[PMo12O40]3-,之前我用赝势LANL2DZ/6-31G**,作业交进去,一天多就停算了,也没有任何出错信息,试了好几次都这样,也不知道是为什么。
3楼2013-07-22 09:35:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zindo

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
确如beefly所说,Gaussian中Zindo模块式ZINDO/S,只用来做激发态单组态相互作用的,不能用于优化和频率计算。
对于多酸的计算,可以试试ADF程序和Turbomole程序,二者做大的过渡金属团簇效率要高些。
4楼2013-07-24 10:18:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zszjn

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我想问一下   用ZINDO计算物质的吸收光谱   考虑溶剂效应  如何写程序
输入文件:
%chk=A44tdCCl4
# zindo=(singlets,nstates=20,direct) SCRF=(PCM,READ,Solvent=CCl4) test

A44

0 1
6             0        1.364338   -0.063497   -0.000145
6             0        1.738460   -1.422772    0.000222
6             0        3.135061   -1.485502    0.000210
6             0        3.606980   -0.175021   -0.000277
7             0        2.555082    0.681249   -0.000519
1             0        1.028947   -2.235721    0.000495
1             0        3.748953   -2.374535    0.000425
1             0        4.621149    0.199623   -0.000492
6             0       -1.173784    0.088505    0.000203
6             0       -1.666460   -1.294728    0.000817
6             0        2.672262    2.132326   -0.000632
1             0        3.730487    2.395105   -0.002318
1             0        2.207739    2.564809   -0.891564
1             0        2.210457    2.564837    0.891718
6             0        0.107004    0.586807   -0.000126
1             0        0.158880    1.674296   -0.000389
6             0       -2.383461    0.884516    0.000209
7             0       -3.458513    0.156431   -0.000102
8             0       -3.043419   -1.210607   -0.000194
8             0       -1.109854   -2.376105    0.000285
6             0       -2.496344    2.376208    0.000306
1             0       -2.016506    2.807365    0.885746
1             0       -2.015388    2.807582   -0.884417
1             0       -3.548854    2.665522   -0.000312

ALPHA=1.21
TSARE=0.4
输出错误:
No SCRF with semi-empirical or MM.
Error termination via Lnk1e in d:\g03\l1.exe at Mon Sep 15 16:35:22 2014.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  0.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      7 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
做回自己
5楼2014-09-15 16:58:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dlstella 的主题更新
信息提示
请填处理意见