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有unnatural amino acids 的 peptide的model
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想做一个collagen peptide (proline-hydroxylproline-glycine)36 的triple helix结构model,网上只找到 (proline-hydroxylproline-glycine)10 的pdb，不知道有什么办法可以从pdb里面含有10个repeat的peptide延长到36个repeat? 因为有hydroxylproline，搜了很多同源建模的教程都只认天然氨基酸，在此发帖向给位大神求教。 本人基本不会编程，看了modeller的教程看得都傻眼了。modeller gui 貌似也不能处理非天然氨基酸 |
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