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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 有没有什么参量能够比较两个体系的相似性
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wyding

木虫 (正式写手)

[交流] 有没有什么参量能够比较两个体系的相似性 已有2人参与

我做的是用分子动力学模拟一个碰撞的实验，想要知道碰撞后与之前的结构上的差别或者说统计缺陷的数目吧！
本来想统计下原子位移超过1 Angstrom 的原子个数，可后来有很多自修复，缺陷几乎没有了，我的统计量却还很大,
所以想问问大家，有没有什么参量能够比较两个体系的相似性。
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向强者看齐，即使高度不够也是昂首挺胸！
1楼 2013-07-10 10:29:47
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
RMSD
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2楼2013-07-10 12:46:51
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sciencejoy

新虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
分布函数、结构因子、……
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3楼2013-07-10 14:00:20
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wyding

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yalefield at 2013-07-10 12:46:51
RMSD

希望是一种参量，能够直接给出对体系破坏大小的统计量！
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向强者看齐，即使高度不够也是昂首挺胸！
4楼2013-07-10 14:08:44
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wyding

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by sciencejoy at 2013-07-10 14:00:20
分布函数、结构因子、……

这些不能把对体系的破坏量化，最好有量化的参数。
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向强者看齐，即使高度不够也是昂首挺胸！
5楼2013-07-10 14:09:50
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sciencejoy

新虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by wyding at 2013-07-10 14:09:50
这些不能把对体系的破坏量化，最好有量化的参数。...

配位数
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6楼2013-07-10 18:31:00
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wyding

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by sciencejoy at 2013-07-10 18:31:00
配位数...

是一个好主意，应该可以统计体系中偏离晶体配位数的原子个数，这应该能表征缺陷的多少！我试试，谢谢你的主意！
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向强者看齐，即使高度不够也是昂首挺胸！
7楼2013-07-11 20:59:31
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