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小红豆

主管区长 (知名作家)


[资源] 推荐:GaussView高级技巧

十个基本高级技巧
摘要:
本文主要介绍了利用GaussView 分子模型的十个高级技巧,其中大多数技巧是鲜为人知的。这些技巧的组合能够使GaussView发挥巨大威力,可以快速方便地构造出复杂的分子结构。最后,以构造乙烷的重叠式构象和二茂铁结构为例进一步说明了这些高级技巧的具体应用。

http://www.quantumchemistry.net/ ... ew/200710/1222.html

在GaussView中建立自己的模型面板
http://www.quantumchemistry.net/ ... ew/200702/1188.html

GaussView的一些实用技巧

GaussView的一些实用技巧

  1)在GaussView中怎样实现把某两个H原子取代成F原子呀?
  拿F原子直接点在H原子上就行了。

  2)GAUSSVIEW下如何显示氢键?
  从原子间距判断。
  GaussView存在一些问题,其结构数据会与你的结果文件中有差别,而且
  原子间距还会随你改变图形而变化,甚至与你先看哪个键后看哪个都有关,
  这些问题在Chem3d 或hyperchem等中就不存在,但这些需要把.log or .out
  or .chk文件进行转换后才可以。而且Chem3d的图形不如其他光华圆润。

  3)如何用GaussView来可视化分子轨道?
  在gaussview中也需要.fchk或.chk文件才能可视化分子轨道和电子密度

  4)如何设定等值面半透明?
  有网格线的选项的,好象是在view|Display format里设一下

[ Last edited by wuli8 on 2009-6-13 at 21:38 ]
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miyanhappy

金虫 (著名写手)


★★★ 三星级,支持鼓励

2 楼给的这个我有用哦 不可可惜完全不懂怎么用
4楼2008-05-29 07:26:18
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★ ★ ★ ★
小红豆(金币+4,VIP+0):辛苦啦!谢谢!
下载一个免费的Molekel

http://bioinformatics.org/molekel/wiki/Main/HomePage

支持文件格式:

alc -- Alchemy format
bgf -- MSI BGF format
box -- Dock 3.5 Box format
bs -- Ball and Stick format
c3d1 -- Chem3D Cartesian 1 format
c3d2 -- Chem3D Cartesian 2 format
caccrt -- Cacao Cartesian format
cache -- CAChe MolStruct format [Write-only]
cacint -- Cacao Internal format [Write-only]
car -- Accelrys/MSI Biosym/Insight II CAR format [Read-only]
ccc -- CCC format [Read-only]
cht -- Chemtool format [Write-only]
cmlr -- CML Reaction format
com -- Gaussian 98/03 Cartesian Input [Write-only]
copy -- Copies raw text [Write-only]
crk2d -- Chemical Resource Kit 2D diagram format
crk3d -- Chemical Resource Kit 3D format
csr -- Accelrys/MSI Quanta CSR format [Write-only]
cssr -- CSD CSSR format [Write-only]
ct -- ChemDraw Connection Table format
cube -- Gaussian cube [Read-only] - Supports orthogonal bases only
dmol -- DMol3 coordinates format
ent -- Protein Data Bank format
feat -- Feature format
fh -- Fenske-Hall Z-Matrix format [Write-only]
fix -- SMILES FIX format [Write-only]
fpt -- Fingerprint format [Write-only]
fract -- Free Form Fractional format
fs -- FastSearching Index
g03 -- Gaussian98/03 Output [Read-only]
g98 -- Gaussian98/03 Output [Read-only]
gam -- GAMESS Output [Read-only]
gamin -- GAMESS Input [Write-only]
gamout -- GAMESS Output [Read-only]
gau -- Gaussian 98/03 Cartesian Input [Write-only]
gpr -- Ghemical format
gr96 -- GROMOS96 format [Write-only]
hin -- HyperChem HIN format
inp -- GAMESS Input [Write-only]
ns -- ShelX format [Read-only]
jin -- Jaguar input format [Write-only]
jout -- Jaguar output format [Read-only]
mdl -- MDL MOL format
mmd, mmod -- MacroModel format
mol -- MDL MOL format
mol2 -- Sybyl Mol2 format
molden -- Molden input format [Read-only]
mopcrt -- MOPAC Cartesian format
mopout -- MOPAC Output format [Read-only]
mpd -- Sybyl descriptor format [Write-only]
mpqc -- MPQC output format [Read-only]
mpqcin -- MPQC simplified input format [Write-only]
msms -- Michel Sanner'MSMS input format [Write-only]
nw -- NWChem input format [Write-only]
nwo -- NWChem output format [Read-only]
pc -- PubChem format [Read-only]
pcm -- PCModel format
pdb -- Protein Data Bank format
pov -- POV-Ray input format [Write-only]
pqs -- Parallel Quantum Solutions format
prep -- Amber Prep format [Read-only]
qcin -- Q-Chem input format [Write-only]
qcout -- Q-Chem output format [Read-only]
report -- Open Babel report format [Write-only]
res -- ShelX format [Read-only]
rxn -- MDL RXN format
sd, sdf -- MDL MOL format
smi -- SMILES format
t41 -- ADF Tape41 format [Read-only]
test -- Test format [Write-only]
tmol -- TurboMole Coordinate format
txyz -- Tinker MM2 format [Write-only]
unixyz -- UniChem XYZ format
vmol -- ViewMol format
xed -- XED format [Write-only]
xyz -- XYZ cartesian coordinates format
yob -- YASARA.org YOB format
zin -- ZINDO input format [Write-only]
zmatrix -- Z-Matrix input [Read-only]
2楼2007-10-25 10:39:11
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fox-fox

木虫 (知名作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐



2楼老汉yalefield是位世外高人啊!常常有许多惊人的见解,不过你的帖子很多,但不知为何少有资源贴,若能把好资源拿出一些指教一下我这样的新手,真是感激不尽。
3楼2007-11-03 01:02:27
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红枫叶688

木虫 (小有名气)


★★★ 三星级,支持鼓励

各位都是高手,我还是小小菜鸟,呀,不敢妄加评论
5楼2008-06-03 20:09:31
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