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liujuanzzu银虫 (正式写手)
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高分子蛋白质之间相互作用，熵焓变问题。求深入讨论。 已有3人参与
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我现在在做一个聚合物，可与小peptides, protein非共价键相结合。我做了一系列ITC，得出相互作用的相关热力学参数，如图。当与小分子his6相结合时，基本与，配位单体与his6相结合H变相同。但与蛋白质结合时，熵焓变化巨大。我的理解可能是因为氢键的形成。我跟一老人讨论，他的意思是聚合物在水中时为无规线团，相当于球状聚合物于球状蛋白相结合，聚合物有一些影响，polymer effect，但说不清楚明白。 可以说聚合物bind protein以后，聚合物受限，每个链段都受限，所以熵降低很大。但如何解释焓呢？求深入详细的解释。先谢了。 Picture4.png |
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caominone: 金币+2, 感谢应助 2015-07-30 10:42:40
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所有情况下自由能的变化都很接近，所以KD很接近，分子间相互作用的很多过程都有熵焓互补的现象（entropy－enthalpy compensation），这两个参数对细微变化都很敏感，所以通常用自由能来比较更方便。 （以下属于个人分析，不一定对，：随着蛋白质分子量的增加，参与的弱的分子间相互作用增多，因此焓变增加 （有利因素），而相互作用力越强，相互作用的两个组分的自由度丧失越多，因此熵减增多（不利因素）。所以整个过程是焓驱动，但是熵焓同时变化，最后表现出的自由能基本不变。） |
8楼2015-07-29 13:13:32