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转录组分析中,KEGG pathway中怎么根据丰度对各个EC number着色？ 已有1人参与
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rt， ，楼主纯小白，请好心的虫友指点指点，万分感谢！！！！！ |
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libranjie
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【答案】应助回帖
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http://www.genome.jp/kegg/tool/map_pathway2.html 如果你输入了合适的可以识别的ID，例如KO编号，加颜色，将基因组的基因对应的KO编号输入KEGG就会得到图片， 其中存在的呈色彩，不通、不存在的用黑色表示。 如果是表达丰度上的，先确定基因的KO编号，然后根据编号把KEGG上的 mapxxxxx.conf中读取位置信息，进行着色，程序可以搞定的。 |
2楼2013-12-26 17:12:16