24小时热门版块排行榜    

查看: 1308  |  回复: 0

841983473

铜虫 (小有名气)

[求助] 菌株鉴定---惶恐!!真菌的18srRNA在NCBI上blast结果

两段序列如下,我用TBLASTX和BLASTN, 选择refseq_rna库,结果都是跟一种细菌同源性最高;我后来又用了BLASTN,nr库,最高的是叶绿体DNA;不知道是我比对的问题,还是序列的问题,还是染菌了,不懂,求解!!!
>rRNA_05
AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAAC
GGTAACAGGAAGCAGCTTGCTGCTTCGCTGACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGG
GAAACTGCCTGATGGAGGGGGATAACTACTGGAAACGGTAGCTAATACCGCATAACGTCG
CAAGACCAAAGAGGGGGACCTTCGGGCCTCTTGCCATCGGATGTGCCCAGATGGGATTAG
CTAGTAGGTGGGGTAACGGCTCACCTAGGCGACGATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGAC
CAGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATAT
TGCACAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAGGCCTTCGGGTT
GTAAAGTACTTTCAGCGGGGAGGAAGGGAGTAAAGTTAATACCTTTGCTCATTGACGTTA
CCCGCAGAAGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAA
GCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTTTGTTAAGTCAGATGTGA
AATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATCTGATACTGGCAAGCTTGAGTCTCGTAGAGG
GGGGTAGAATTCCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCTGGAGGAATACCGGTGGCG
AAGGCGGCCCCCTGGACGAAGACTGACGCTCNAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCC
GTAAACGATGTCGACTTGGAGGTTGTGCCCTTGAGGCGTGGCTTCCGGAGCTAACGCGTT
AAGTCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATNNNNNNNNNNNNNGT
GAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGC
AACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGAGACTG
CCAGTGATAAACTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGACCAG
GGCTACACACGTGCTACAATGGCGCATACAAAGAGAAGCGACCTCGCGAGAGCAAGCGGA
CCTCATAAAGTGCGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAA
TCGCTAGTAATCGTGGATCAGAATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACC
GCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGC
>rRNA_06
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACATGCAAGTCGAAC
GGGAAGTGGTGTTTCCAGTGGCGAACGGGTGAGTAACGCGTAAGAACCTGCCCTTGGGAG
GGGAACAACAACTGGAAACGGTTGCTAATACCCCGTAGGCTGAGGAGCAAAAGGAGAAAT
CCGCCCAAGGAGGGGCTCGCGTCTGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATAGCTTACCAAGGC
GATGATCAGTAGCTGGTCCGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAG
ACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCAA
TGCCGCGTGGAGGTGGAAGGCCTACGGGTCGTCAACTTCTTTTCTCGGAGAAGAAACAAT
GACGGTATCTGAGGAATAAGCATCGGCTAACTCTGTGCCAGCAGCCGCGGTAAGACAGAG
GATGCAAGCGTTATCCGGAATGATTGGGCGTAAAGCGTCTGTAGGTGGCTTTTCAAGTCC
GCCGTCAAATCCCAGGGCTCAACCCTGGACAGGCGGTGGAAACTACCAAGCTGGAGTACG
GTAGGGGCAGAGGGAATTTCCGGTGGAGCGGTGAAATGCATTGAGATCGGAAAGAACACC
AACGGCGAAAGCACTCTGCTGGGCCGACACTGACACTGAGAGACGAAAGCTAGGGGAGCA
AATGGGATTAGAGACCCCAGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGGATACTAGGTGCTGTGCGA
CTCGACCCGTGCAGTGCTGTAGCTAACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGTTCGC
AAGAATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAA
T
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 841983473 的主题更新
信息提示
请填处理意见