24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1298  |  回复: 4

亍寞

金虫 (小有名气)

[求助] 求解GAMESS为啥这么慢。。。

换组之后新组都是gamess于是入乡随俗。。。之前无数次的听说gamess效率要比gaussian高,但是随便计算的东西,200基函数左右,B3LYP,6核,gaussian半个小时不到连opt带freq全出来了,gamess光opt就要3小时,而且还没优化出来。。。而且GAMESS下DFT的HESSIAN说是只有数值法,随便测试了一下子。。。那个速度反差更大。。。

g09就是网上下载的包,解压缩写bashrc直接用
GAMESS是比较新的版本,编译语言ifort 11.1 +mkl 11.1,并行用sockets

输入的命令:
gaussian
%nproc=6
%mem=2500Mb
#p opt freq b3lyp/6-31+g(d) scrf=(PCM,solvent=water)

GAMESS:
$BASIS GBASIS=N31 NGAUSS=6 NDFUNC=1 DIFFSP=.TRUE. $END
$CONTRL SCFTYP=RHF RUNTYP=OPTIMIZE DFTTYP=B3LYP MAXIT=100 ICHARG=-1 MULT=1 $END
$STATPT NSTEP=20 $END
$SYSTEM MWORDS=750 $END
$PCM SOLVNT=WATER $END
$DATA

然后gaussian的opt也刚好走了20圈

因为听说gaussian的PCM模型不够好(?)而且需要在gamess里面自己写模块进去,所以还是偏向于gamess。。。
请问咱的这个gamess的输入里面,只写必要的命令其他全部default是不是会有问题呢?这个计算速度的问题应该怎么解决?还是说无法解决?
十分感谢!!!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuy069

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
亍寞: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-06-27 09:52:12
gkf高: 金币+2 2013-06-27 10:54:02
亍寞: 金币+20 2013-10-23 13:49:18
DFT计算还是Gaussian快;HF,post-HF应该是Gamess-US快
sockets比impi编译的要慢些,Gamess-US跨节点并行效率比Gaussian好
2楼2013-06-27 09:28:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

亍寞

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wuy069 at 2013-06-27 09:28:22
DFT计算还是Gaussian快;HF,post-HF应该是Gamess-US快
sockets比impi编译的要慢些,Gamess-US跨节点并行效率比Gaussian好

啊,感谢!顺带一提。。。咱这个gamess的输入文件里面,不影响精度并且提高速度相关的话,有没有什么能够改善的地方呢?
3楼2013-06-27 09:52:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

★ ★
gkf高: 金币+2, 谢谢交流~ 2013-06-27 10:54:20
以前gamess确实比gaussian快,但是g03以后,电子积分、hf和dft的速度快了不少。gamess的另一分支pc-gamess也比较快,但是那些提升速度的选项不是默认设置。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
4楼2013-06-27 10:01:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

亍寞

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by beefly at 2013-06-27 10:01:18
以前gamess确实比gaussian快,但是g03以后,电子积分、hf和dft的速度快了不少。gamess的另一分支pc-gamess也比较快,但是那些提升速度的选项不是默认设置。

感谢指点~方便的话,能麻烦指教一下提升速度的选项主要有什么么?或者说,从什么方面考虑呢?
5楼2013-06-27 13:34:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 亍寞 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 320求调剂 +5 深郊akm 2026-04-17 5/250 2026-04-18 19:52 by 王珺璞
[考研] 化学070300 求调剂 +29 哈哈哈^_^ 2026-04-12 29/1450 2026-04-18 15:56 by Equinoxhua
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[考研] 一志愿华中农业071010,320求调剂 +17 困困困困坤坤 2026-04-14 19/950 2026-04-17 20:08 by 关一盏灯cd
[考研] 304求调剂 +7 castLight 2026-04-16 7/350 2026-04-17 20:05 by 关一盏灯cd
[考研] 307中医考研调剂 +6 于以采蘩 2026-04-14 6/300 2026-04-16 16:20 by qingfeng258
[考研] 322求调剂 +8 123安康 2026-04-12 15/750 2026-04-16 11:07 by Espannnnnol
[考研] 药学求调剂 +14 喽哈加油 2026-04-14 16/800 2026-04-16 10:15 by beilsong20
[考研] 279学硕食品专业求调剂院校 20+7 孤独的狼爱吃羊 2026-04-12 29/1450 2026-04-16 09:00 by screening
[考研] 求调剂推荐 +8 小聂爱学习 2026-04-14 8/400 2026-04-16 07:22 by 学员JpLReM
[考研] 289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校) +4 白云123456789 2026-04-13 4/200 2026-04-16 00:18 by 粉沁若尘
[考研] 通信工程求调剂!!! +6 zlb770521 2026-04-14 6/300 2026-04-15 20:00 by 学员JpLReM
[考研] 药学求调剂 +11 RussHu 2026-04-12 13/650 2026-04-15 19:07 by zhuwenxu
[考研] 0854调剂 +13 长弓傲 2026-04-12 16/800 2026-04-15 13:45 by fenglj492
[考研] 各位老师好,求调剂,本科211,一志愿天津大学生物与医药学硕,差两名录取。 +11 路六六jjj 2026-04-13 11/550 2026-04-14 16:01 by zs92450
[考研] 求调剂 +12 何气正 2026-04-13 13/650 2026-04-14 14:47 by zs92450
[考研] 105500药学求调剂 +4 x_skys 2026-04-12 4/200 2026-04-14 13:37 by rndfc
[考研] 考研英一数一338分 +9 长江大学东校区 2026-04-13 10/500 2026-04-14 00:41 by 王珺璞
[考研] B区0809 ,数一英一,290 求调剂 +3 泠潍1111 2026-04-12 4/200 2026-04-13 20:35 by 学员JpLReM
[考研] 一志愿浙大生物325分求调剂 +9 zysheng 2026-04-12 9/450 2026-04-12 22:31 by yuyin1233
信息提示
请填处理意见