24小时热门版块排行榜    

查看: 1667  |  回复: 3

klaus1987

铜虫 (小有名气)

[求助] QMERA和Dmol3计算结合能 已有1人参与

本人想用QMERA和Dmol3两个模块计算结合能。本来是用QMERA做的,因为其中一个分子完全是QM区域,不能单独用QMERA算,所以又用了Dmol3。这两个模块给出的结果文件里的数据多多,能量有好几个说法,我就是不明白应该用哪个能量呢?跪求高手指教!

下面是dmol3的:
Energy components:
   Sum of atomic energies =    -2374.4959334Ha
                  Kinetic =      -24.1438189Ha
            Electrostatic =       -2.2916013Ha
     Exchange-correlation =        6.2556128Ha
        Spin polarization =        4.0455364Ha
         DFT-D correction =       -0.0590493Ha
      =====================
       Total DFT-D energy =    -2390.6892537Ha
          Total Energy           Binding E       Cnvgnce     Time   Iter
Ef        -2390.689254Ha       -16.1933203Ha      6.09E-07     3.3m      1
df  binding energy     -16.1933203Ha        -440.64285eV      -10161.665kcal/mol
Df  binding energy extrapolated to T=0K     -16.1932774 Ha      -440.64168 eV

然后是QMERA的:
Call to GULP done with exit code 0
...hybrid.calc/gulp/copy_object/================= Tstep:    0.5 Ttot:   64.0 ==
Contribution to energy from                      dmol3:            -0.852168 (a.u.)
Including QM/MM electrostatic energy from        dmol3:            -0.002743 (a.u.)
Contribution to energy from                       gulp:             7.294616 (a.u.)
Contribution to energy from additional MM energy terms:             0.000000 (a.u.)
-----------------------------------------------------------------------------------
QM/MM Energy:                                                       6.442448 (a.u.)
-----------------------------------------------------------------------------------
energy/hybrid.kill/============================== Tstep:    0.0 Ttot:   64.0 ==
energy/hybrid.kill/gulp/========================= Tstep:    0.0 Ttot:   64.0 ==
Energy and gradient evaluations:
QM energies   1
QM gradients  0
MM energies   1
MM gradients  0
-----------------------------------------------------------------------------------
Energy (     hybrid):                                               6.442448 (a.u.)
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

尚伊心

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


franch: 金币-1, 非应助回帖 2013-09-23 20:36:07
你好,请问你有关于Qmera的详细教程吗?
2楼2013-09-22 16:42:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

klaus1987

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 尚伊心 at 2013-09-22 16:42:21
你好,请问你有关于Qmera的详细教程吗?

我是看帮助文件自学的
3楼2013-10-10 10:36:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

竹清松瘦

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

DMOL3里的能量用Total DFT-D energy =    -2390.6892537Ha
QMERA里用QM/MM Energy:                                                       6.442448 (a.u.)
你看他的最后的杂化能一样呀~
4楼2016-01-22 21:16:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 klaus1987 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] fileCode有新解读? +7 Tide man 2026-08-08 13/650 2026-08-08 09:47 by zhengxianzb
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 5/250 2026-08-08 08:59 by 6vVgjDL4CnGu
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 4/200 2026-08-08 08:27 by 6vVgjDL4CnGu
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 4/200 2026-08-08 08:21 by 6vVgjDL4CnGu
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +9 且听虎啸 2026-08-07 12/600 2026-08-07 21:53 by 理想三旬2025
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[论文投稿] 十年后又回来了,论文投稿求助 +4 哈哈114477 2026-08-01 4/200 2026-08-07 14:39 by jgy194592
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +4 yang182083 2026-08-06 6/300 2026-08-07 12:43 by 虫友是什么虫
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 4/200 2026-08-05 09:59 by lfy8008
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 什么时候能放榜呀? +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
请填处理意见