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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 启动子克隆
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flord

铁虫 (小有名气)

[求助] 启动子克隆

各位大侠好，小弟求助一个问题，望各位不吝赐教！
小弟想克隆胡杨HKT基因的启动子，导师让我找一下拟南芥、盐芥和毛果杨这三种植物的HKT启动子然后比较一下差异性，如果差别不是很大的话，想直接设计引物扩增，然后验证。请教一下：
1、这个方案是否可行？
2、不同物种间同一个基因的启动子序列差别如何？
不胜感激！
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一个阳光的大男孩！
1楼 2013-06-02 16:18:00
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逆境植物

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，感谢你的慷慨解囊，期待你的精彩。 2013-06-03 13:44:16
flord: 金币+5, ★有帮助 2013-06-13 12:33:44
建议用Tail-Pcr进行扩增。
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逆境植物学
2楼2013-06-03 11:40:02
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3326449

木虫 (著名写手)
顶！  高手们快来~
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3楼2013-06-03 11:41:52
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冰风颤木

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-06-03 18:21:31
flord: 金币+5, ★有帮助 2013-06-13 12:33:32
应该是可以的 主要是看三者的同源性了啊
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船到桥头自然直
4楼2013-06-03 13:34:59
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tigertang

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-06-03 18:21:39
flord: 金币+10, ★★★很有帮助, xiexie ! 2013-06-13 12:33:20
拟南芥、盐芥的基因组序列已知，直接设计引物扩增即可。胡杨如果基因组没有测序的话，只能根据克隆的CDS序列，往上游walking，克隆启动子的序列。clontech有做genomic walking的试剂盒，应该可以满足你的要求。
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5楼2013-06-03 14:01:22
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20134976

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 逆境植物 at 2013-06-03 11:40:02
建议用Tail-Pcr进行扩增。

我也是要扩启动子的，，不太明白Tail-PCR跟genome walking是有什么区别，可否赐教？？
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6楼2013-08-26 11:32:19
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20134976

新虫 (小有名气)
是可行的，我们实验室有人用这种方法的。。
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7楼2013-08-26 11:33:33
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xinpengfei

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 20134976 at 2013-08-26 11:32:19
我也是要扩启动子的，，不太明白Tail-PCR跟genome walking是有什么区别，可否赐教？？...

请问你的启动子怎么克隆的？另外，Tail-PCR跟genome walking是有什么区别啊？
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8楼2015-12-01 22:39:04
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