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hanpeng972

木虫 (著名写手)

硬汉集中营

[求助] 求助:关于采用Nosé thermostat冷却退火和重融的过程

文献中有这样一句话"The water structure was annealed and cooled using a Nosé thermostat and then re-converged."翻译过来应该是“水体系采用Nosé thermostat冷却退火后重融。”
那么这个退火过程是采用Forcite模块Calculation-- Dynamic--Thermostat下面的Thermostat下面的Nosé 一个模块进行的退火和重融过程?还是上面过程只可以模拟退火过程而不能实现重融过程?如果只可以单独进行退火过程,那么如何实现其重融过程呢?

还有就是模拟构建一个水体系的话,MS中除了Construct工具以外还有什么其它办法么?
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青春无悔
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动感球球

木虫 (小有名气)


sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-06-13 00:15:49
我用Discover做过无机盐水溶液的模拟,构建模型的时候是用的amorphous cell这个模块。
空穴来风
2楼2013-06-11 13:31:13
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hanpeng972

木虫 (著名写手)

硬汉集中营

引用回帖:
2楼: Originally posted by 动感球球 at 2013-06-11 13:31:13
我用Discover做过无机盐水溶液的模拟,构建模型的时候是用的amorphous cell这个模块。

您好,请问您涉及过采用NOSE进行退火然后重熔的过程么?
青春无悔
3楼2013-06-11 21:02:52
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动感球球

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hanpeng972 at 2013-06-11 21:02:52
您好,请问您涉及过采用NOSE进行退火然后重熔的过程么?...

这个没有
空穴来风
4楼2013-06-12 14:39:36
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hanpeng972

木虫 (著名写手)

硬汉集中营

引用回帖:
4楼: Originally posted by 动感球球 at 2013-06-12 14:39:36
这个没有...

恩 依旧感谢
青春无悔
5楼2013-06-12 17:10:49
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-06-13 14:23:56
hanpeng972: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-06-13 16:06:53
hanpeng972: 金币+25, ★★★★★最佳答案 2013-07-25 11:10:24
我的理解是用Nose控温模拟退火后,再做几何优化
构建水溶液,貌似没有比AC更方便的做法了吧,不过应该AC后跟个MD更好
6楼2013-06-13 12:25:26
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hanpeng972

木虫 (著名写手)

硬汉集中营

引用回帖:
6楼: Originally posted by xujc1983 at 2013-06-13 12:25:26
我的理解是用Nose控温模拟退火后,再做几何优化
构建水溶液,貌似没有比AC更方便的做法了吧,不过应该AC后跟个MD更好

您好,请问您的意思是NOSE过程可以实现我的退火和冷却过程,后面我描述的重融过程需要跟进集合优化对吗?那么如果跟进几何优化的话需要跟进动力学的集合优化么?
青春无悔
7楼2013-06-13 16:08:10
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚


sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-06-14 14:23:38
引用回帖:
7楼: Originally posted by hanpeng972 at 2013-06-13 16:08:10
您好,请问您的意思是NOSE过程可以实现我的退火和冷却过程,后面我描述的重融过程需要跟进集合优化对吗?那么如果跟进几何优化的话需要跟进动力学的集合优化么?...

是的,退火本身就有冷却的过程啊
MD后的结构来做几何优化
8楼2013-06-14 13:00:09
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