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hoc2h2

铁杆木虫 (著名写手)

Dr.

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专业: 有机合成

[交流] 有机化学和药物化学已有1人参与

偶然看到几个帖子，说有机化学和药物化学的关系，看下来有很多不太恰当的观点甚至还有些误导的观点，我想根据我个人的经历，说两句关于有机化学和药物化学的事情吧。
纯粹的有机化学注重的东西很专一：合成以及合成的方法，众多的有机化学的分支大多数都是在研究这两个课题。然而有机化学本身作为工具的用途实在是广泛，在材料，制药，生产工艺，化学生物学，环境科学。。。都有很多用途。
每个学科都有很多的研究方法和研究工具，就像做饭需要锅铲碗瓢，药物化学的研究工具中，就离不开有机化学，而药物化学中的有机化学，更注重的是合成的功能。
从新药研发的大背景下来看，药物化学从hit的发现到lead optimization，直至产生一个preclinical candidate都贯穿着发挥着作用，有机合成就像是把钥匙，帮助着打开这些过程中遇到的一扇扇门，然而这些门往往都不会只有一把锁。比如生物测试assay的建立，需要生物学的钥匙，SAR的研究，需要统计学，需要结构化学的钥匙，ADMET的研究，需要代谢学，毒理学的钥匙，靶点和机理的研究，又需要相关生理病理学的钥匙。
说了这么多，作为药物化学工作者和有机化学工作者之间到底有些什么区别呢，其实最主要的一点就是研究药物化学要知道提出怎样的结构才能解决遇到的问题，而不必过分纠结实现这个结构的合成路线是否经济（只要是可实现的）。这是个说起来很容易的事情，可是仔细想想你就知道，上面提到的所有领域你都必须有涉及，甚至是深入涉及。
其中包括化学相关的，比如在筛选阶段，前些年比较火热的组合化学的概念，还有现在仍然有人在推崇的diversity-oriented synthesis，以及成果颇为丰富的Fragment-based drug design，这些知识都是一个合格的药物化学工作者（严格的讲应该是leader）应该具备的。
要保持一个研发项目的进行，需要了解所研究的疾病的一些基础知识，如果有相关靶点的结构信息，可能会需要Structure-based design，可能要进行virtual screening。这些东西都不一定由你来做，但是如果不了解就没有办法用好从这些方法得到的信息。
剩下的就是分析从生物数据中得到的信息，如何改造结构以提高化合物的生物活性？这是药物化学的精髓部分，SAR怎么建立；bioisostere怎么用；scaffold hopping怎么考虑；F在哪里加；代谢稳定性不好，怎么提高；吸收不符合要求，怎么提高；CNS药物不能通过BBB，怎么改造；毒性太大，怎么降低；QSAR；各assay之间的相关性？。。。
当一个药物能够进入前临床，药物化学的工作基本就结束了，随后大量样品的提供就交给工艺研发部门了。

我以前的老板说过，Medicinal Chemistry is a learning process。说的很对。

这帖子的目的是想给想进入药物化学领域的虫子一些可借鉴的东西，很多学药化的同学可能太注重有机化学的基础而忽略了很多相关领域的研究，而实际上这些东西对药物化学的重要性完全不在有机合成之下。

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