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小虫子MM

铜虫 (初入文坛)

[求助] 包涵体复性

包涵体过镍柱,并进行了尿素梯度透析,6M-0M,请问一下,梯度透析之后尿素能除净吗,怎么鉴别尿素是否除净,蛋白是否复性成功?之后要做抑菌试验的,尿素一定要除去的。希望大家给点意见。
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qianshengguo

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+1, 鼓励发帖交流! 2013-05-22 21:40:01
肯定不能完全除尽,只不过是将尿素的浓度降到一定程度而已。理论上,最后的浓度可以根据透析的体积比例计算出来。
2楼2013-05-22 14:22:58
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会思想的芦苇

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 金币+1, 谢谢参与 2013-05-23 08:03:04
我也一直在找检测尿素是否透析干净的方法,但一直没有找到,不过正如楼上所说 可以根据透析体积和换液次数来计算,但一定要保证每次透析都透析完全。至于复性问题,可能没有那么简单,并不是尿素除净就可以复性成功,一个大老难问题,透析的时候可以在buffer里加人精氨酸和谷胱甘肽
3楼2013-05-22 14:40:25
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小虫子MM(amisking代发): 金币+4 2013-05-22 21:40:12
小虫子MM: 金币+11 2013-05-25 15:49:06
楼上几位说的都很有道理!  我不知你倒数第二步的Urea浓度是2M,还是1M?
打个比方,假如你倒数第二步的Urea浓度是1M!你蛋白的体系是20ml,你0M Urea的buffer是2L!
1).假如你将20ml含1M Urea的protein复性到0M Urea的buffer 2L中!你可以计算一下,你最终体系中的Urea含量应该是10mM!
2).假如你将20ml含1M Urea的protein复性到0M Urea的buffer 1L中,到体系内外达到平衡后再复性到0M Urea的buffer 1L中!(也就是换液一次!)你最终Urea的浓度被稀释50*50=2500倍!也就是最终含有0.4mM的Urea!

建议你复性的时间长点!一天或者更长(只是针对比较复杂的蛋白复性来说)!一般蛋白复性6~7h就够了!

并不是所有蛋白复性都需要加Arg和GSH氧化还原系统!有的蛋白在PBS等缓冲体系中就能复性!不需要添加任何稳定剂的!你添加Arg是增加了protein  refolding 的中间结构的稳定性!但也避免不了你又引入新的干扰因子!Arg可能对你做科研实验有一定的影响!所以能不加就不加!!!
氧化还原系统只是针对还有二硫键的蛋白的renaturation有作用!如果你的protein不含有巯基怎么办呢?那不是又白加了吗????(好吧!我扯得太远了!!

希望以上建议对你有用!
长得比我英俊的,没我有才华!有才华的,没我长得俊!
4楼2013-05-22 18:55:07
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志子

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 金币+1, 谢谢参与 2013-05-23 08:03:48
通过透析袋或凝胶柱,最大限度地降低尿素的浓度,这样做可以有效降低各种副作用
5楼2013-05-22 21:37:40
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小虫子MM

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 不转录的DNA at 2013-05-22 18:55:07
楼上几位说的都很有道理!  我不知你倒数第二步的Urea浓度是2M,还是1M?
打个比方,假如你倒数第二步的Urea浓度是1M!你蛋白的体系是20ml,你0M Urea的buffer是2L!
1).假如你将20ml含1M Urea的protein复性到0M ...

我用的是 6M  4M 2M 0M  每个梯度12h。
请问我是0M透析之后,放入PBS缓冲液中吗?需要放多长时间啊?
我透析之后粗略做了一下抑菌实验,没有抑菌环。不知道哪步出问题了!请大侠帮帮忙!
6楼2013-05-24 09:02:48
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生物小通

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
来学习的,我们也做变性复性的,如果是复性抗体的话,是否成功好检测,但是其他的就不清楚了。根据我们复性抗体知道复性是非常困难的。
第一,复性条件要具体情况具体分析,尤其是有二硫键,氧化还原系统的比例要具体分析并控制。
第二,复性成功率,即便是能够找到复性的条件,但是复性成功率依旧是个问题,好似一般的在20%左右,当然这个跟蛋白的关系很大。
第三,透析浓缩,你在变性复性、透析浓缩中,随时间推移,蛋白质自身就会失活,尤其是在透析浓缩中,因为蛋白浓度降低,本身失活,透析并不是无菌环境,因此会降解。时间越久,损失越大,可以通过SDS-PAGE分析蛋白降解问题。
由上面可以知道,我们这种研究所,一般没有特别优秀的老师指导及特殊设备复性,真正成功并获取活性的蛋白会非常非常小(当然这个一般的蛋白在无特殊设备的情况下很难确定是否复性成功)。
我是用的可溶性表达,建议以可溶性表达进行优化表达条件,或者换载体之类的。这种成功的可能性更大。
学习,进步
7楼2013-05-24 09:32:20
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 小虫子MM at 2013-05-24 09:02:48
我用的是 6M  4M 2M 0M  每个梯度12h。
请问我是0M透析之后,放入PBS缓冲液中吗?需要放多长时间啊?
我透析之后粗略做了一下抑菌实验,没有抑菌环。不知道哪步出问题了!请大侠帮帮忙!...

1. 如果你感觉是你的蛋白有问题,建议你先将你的蛋白跑个SDS-page!检测蛋白有木有减少和蛋白浓度够不够高!能不能达到你抑菌试验的要求!!!!
2. 如果你感觉你的蛋白透析的问题!是不是你的蛋白中含有什么物质干扰你的抑菌试验!你可以看看相关文献介绍!
3.如果蛋白没有问题!那是不是你的培养皿中的培养基出了问题,还是你的抗生素有问题,或者是你的菌已经不能正常生长了!还有你的菌生长的最适温度是不是你的培养温度!
长得比我英俊的,没我有才华!有才华的,没我长得俊!
8楼2013-05-24 11:30:10
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lwj861228

木虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 会思想的芦苇 at 2013-05-22 14:40:25
我也一直在找检测尿素是否透析干净的方法,但一直没有找到,不过正如楼上所说 可以根据透析体积和换液次数来计算,但一定要保证每次透析都透析完全。至于复性问题,可能没有那么简单,并不是尿素除净就可以复性成功 ...

可以通过测电导来检测尿素是否透析干净。
努力才会有希望!
9楼2014-07-14 08:47:11
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