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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 高斯09计算，不分层时能正常计算。分层时提交出现错误
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qiaodan1029

新虫 (小有名气)

[求助] 高斯09计算，不分层时能正常计算。分层时提交出现错误

分层提交时出现
Error: segmentation violation
   rax 0000000000000000, rbx ffffffffffffffff, rcx ffffffffffffffff
   rdx 00000000000011fd, rsp 00007fff0a434cc8, rbp 00007fff0a4352a0
   rsi 000000000000000b, rdi 00000000000011fd, r8  00002b76a0d436e0
   r9  0000000000000000, r10 0000000000000000, r11 0000000000000202
   r12 0000000000000000, r13 0000000000000000, r14 00007fff0a4352e8
   r15 00002b76b9ce0f28
  --- traceback not available
.log的最后几行：
atom 63 layer R linked to atom 71 is also bonded to atom 67 in layers bad because scale factors are defaulted or not 1.atom are bonded to more than one atom in an inner layer and have non-unit factor. Terminating because of bad ONIOM partition.Error termination via linkle in /home/lab/g09/1101.exe
63.71.67是体系中的原子序号。
请大神们忙帮看下原因，小女子不甚感激
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迫切的等待着2014
1楼 2013-05-14 09:56:15
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990: 金币+2 2013-08-23 18:38:18
输出文件说的很清楚啊，处于分层位置的原子只能和另一层的一个原子相连接，如果连接了多个就会出现这个错误。
你这里是第63号原子（指的是编号，不是原子序数）同时连接了另一层的71号和67号原子，因而出错。
这说明你的层次分的不符合规范。重新设计一下原子的层次归属吧！
赞一下 回复此楼
据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
3楼2013-08-23 18:02:56
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castorsunqq

金虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by hairan at 2013-08-23 18:02:56
输出文件说的很清楚啊，处于分层位置的原子只能和另一层的一个原子相连接，如果连接了多个就会出现这个错误。
你这里是第63号原子（指的是编号，不是原子序数）同时连接了另一层的71号和67号原子，因而出错。
这说 ...

难道分层的时候一个low layer的原子不能连接两个high layer的原子吗
赞一下 回复此楼
4楼2014-04-20 13:32:44
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