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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 完善进化树
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jlf8858

铜虫 (初入文坛)

[求助] 完善进化树

最近做了个进化树，感觉不是太好，置信度有点低，很多都在50以下。我想问问什么样的进化树才是成功的进化树，如果不好该怎么修正？
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1楼 2013-05-08 20:28:24
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螺旋的歌

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
laozuzunzhe: 金币+3, 鼓励应助交流！ 2013-05-27 08:21:17
你的是菌的吗？如果是菌的话，那真奇怪，BLAST之后应该会有很多同属或者同种的类似序列，MAX IDENT都很高的，做出来的进化树的可信度数值应该都会挺高的。看看你自己的进化树是否需要设置外群吧？一般发现新菌貌似可能性比较低。进化树的构建，看你的目的所在，如果是为了确定菌的进化地位的话，一般8-9株菌株进行比较，我也看过很少的就3-4株菌株比较的，进化树关键是能够体现你想要表达的信息。如果是蛋白质之间的关系，进化树可能会庞大一些。
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2楼2013-05-27 00:07:22
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