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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » MS6.0并行使用必须使用Intelmpi？！我装的是MPICH2 难道不行？！
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tonglijia

木虫 (正式写手)
在“MS6.0 for linux下载、集群上并行安装、CASTEP提交作业脚本及多核运行”中提到了：(4) 因MS6.0 for linux支持intel mpi 并行，建议在安装前先安装intel mpi，并
   [msi@node1]$  source /opt/intel/impi/4.0.3.008/intel64/bin/mpivars.sh
可是我安装的是MPICH2所以这一步的操作我不知道该如何在我的系统中实现
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人，要靠自己！！！
11楼2013-05-07 08:47:07
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tonglijia

木虫 (正式写手)
内容已删除
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人，要靠自己！！！
12楼2013-05-07 08:47:52
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风间的记忆

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
MS本身用什么MPI编的就必须用什么MPI
所以如果他用的shiINTELMPI 那必然只能用INTELMPI
MS是界面化软件
源码及编译是封装的
所以无法改用其他MPI
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九州浩淼，任其东西，明日何在，但随我意。
13楼2013-05-07 09:12:38
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sjzxbe

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
MS6.0 随机帮助中指出：  Installation Administrator中
IA32 and x86-64 Linux clusters
Hardware minimum
Intel Pentium 4 or compatible (x86, x86-64) processors running at 1 GHz or greater
1 GB RAM (2 GB recommended) per node
1.4 GB disk space per node
Homogeneous clusters (identical processors, identical OS, libraries, etc., on each node) only
Interconnects supported by Intel MPI. For MPI-parallel Materials Studio applications that are only supplied as 32-bit binaries (MesoDyn), when running on AMD64 or EM64T platforms, TCP will be used on the Infiniband and Elan interconnects. Note that some Infiniband Drivers work only with Linux kernel versions 2.6.16 (included with Red Hat 5) or higher.
Beowulf architecture, with a head node that holds the file system, Materials Studio installation, and user data. These files must be mounted and visible to the compute nodes at the same location as on the head node
Compute nodes must be set up to communicate with each other and the head node through rsh or ssh without a password (for MPI)
A license file or license server must be installed on the head node, unless the compute nodes are configured so that they can access a license server elsewhere
This is a recommended minimum specification. Greater processing power, speed, and memory are recommended for any heavy duty use. It is strongly recommended that you use a supported queuing system to ensure an even distribution of jobs between the different processors. There are no graphics-related requirements for running Materials Studio on Linux clusters.

For details of Intel MPI please refer to the  Intel Cluster MPI Libraries documentation.
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14楼2013-05-07 13:28:58
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sjzxbe

木虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by sjzxbe at 2013-05-07 13:28:58
MS6.0 随机帮助中指出：  Installation Administrator中
IA32 and x86-64 Linux clusters
Hardware minimum
Intel Pentium 4 or compatible (x86, x86-64) processors running at 1 GHz or greater
1 GB RAM ( ...

要求用IntelMPI

未命名-2.png
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15楼2013-05-07 13:33:38
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saikun

木虫 (正式写手)
你这个是qsub的问题，原因很多的，例如你有没有在qsub投job的权限，另外免费版的qsub跟MS也不甚相容，LSF好很多（但要＄＄＄）。

试试不用qsub投job看看。
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16楼2013-05-07 15:40:07
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
MS不是用的HPMPI么？
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思想重于技巧，内涵重于表象
17楼2013-05-07 21:40:22
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xyzzz986

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
看错误信息显然是无法通过qsub提交作业。

你的windows客户端可能配置有问题。5.0是可以直接提交的，不必须通过队列管理器(qsub之类）提交。以后的版本，我还没来得急吃螃蟹。
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18楼2013-05-08 08:38:31
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tonglijia

木虫 (正式写手)
引用回帖:
18楼: Originally posted by xyzzz986 at 2013-05-08 08:38:31
看错误信息显然是无法通过qsub提交作业。

你的windows客户端可能配置有问题。5.0是可以直接提交的，不必须通过队列管理器(qsub之类）提交。以后的版本，我还没来得急吃螃蟹。

工程师也说了这个问题，说ＰＢＳ安装有问题　　　谢谢您的帮助！！！！
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人，要靠自己！！！
19楼2013-05-08 16:36:19
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tonglijia

木虫 (正式写手)
引用回帖:
17楼: Originally posted by souledge at 2013-05-07 21:40:22
MS不是用的HPMPI么？

非常感谢您的帮助！工程师说MS自带Intelmpi 安装ms时mpi自动安装
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人，要靠自己！！！
20楼2013-05-08 16:37:06
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