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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 基因敲除后遇到很怪的现象，求解释。谢谢！
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

“B酶有两个拷贝，记作B1、B2”------B1和B2的碱基序列相同，是吗？
如果B1和B2的碱基序列相同且A酶与B1酶的阅读框紧邻，B2的阅读框离B1相距1000多个阅读框（应该是1000多个碱基？）也就是离A酶的阅读框相距1000多个碱基。
这是如果当单独敲除B2时，发现A大幅上调，那木很可能是构成了新的enhancer,enhancer 必须在远距离起作用，而你的实验结果正反，敲除离A近的使得A表达量上升，敲除远端的倒是没有作用。
这样可以从两个角度考虑：1.敲除B1时，破坏了可以影响到A表达的隔离子序列，且A上游可能有能够对于A表达起促进作用的enhancer ，检测这个假设，你可以同时在敲除B1时检测A邻近的几种其他蛋白质的表达量是否也有上升，如果也有较明显的上升，那么这个假设可能成立；2.A与B1的转录机器可能存在彼此干扰，检测这假设，可以用电镜观察A与B1的转录的转录机器的相互位置。
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11楼2013-05-09 12:18:42
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by rivergf at 2013-05-09 09:35:13
A上调是指RNA表达量上调。

我列出的是这两个酶催化的反应，生物体内肯定还有一系列的其他反应。...

这个就是我想说的，你这种情况下不能光考虑这2个基因，一般都是network，有可能有C，D等基因牵涉其中。
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12楼2013-05-09 19:43:46
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