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fustar08木虫 (小有名气)
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[求助]
一未知蛋白PMF 肽指纹结果如何分析呢 有图，有反应条件
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本虫是做酶工程的，筛到一株细菌得到一纯化蛋白，但是不知道该功能，于是联系一公司做了PMF测定。但是结果不知道怎样分析，也不明白该公司测定得有没有价值。请各位大侠帮帮忙指点迷津。 目标：通过PMF预测该未知蛋白大概是个什么蛋白 样品：细菌发酵液纯化的胞外蛋白 分子量33 KDa（SDS-PAGE测定） 处理：Trypsin酶解 PMF仪器型号：ultraflex tof/tof Bruker 附件：公司测定结果Mascot比对 问题： 1.PMF结果在Macsot上比对的结果显示最相似的蛋白为threonine dehydratase biosynthetic 1，其余均是些预测蛋白，但是酶活测定发现不是该种蛋白。 请问检测的结果还可以获得哪些有用的信息吗？感觉花钱打了水漂。 2.该菌株的属有基因组报道，有预测蛋白，通过自建库有没有什么帮助（自建库的原理我也不是太明白）。  DW20_G71.jpg [ Last edited by fustar08 on 2013-5-3 at 23:32 ] |
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2013-05-03 23:14:03, 162.08 K
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