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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » TS confirmation无法进行，求大牛指导
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qj1989630

银虫 (小有名气)

[求助] TS confirmation无法进行，求大牛指导 已有1人参与

TS confirmation提交后，马上就失败，显示以下原因
Error: Molecular superposition and fix atoms are incompatible
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
目前考虑是不是我在搜索过渡态前原子配对时没有勾选superimpose structures有关，可是在勾选时TS Search时就不能进行，又显示以下错误
Error: Fixed coordinate mismatch:   70.958090  70.889874
Error: Fixed coordinates should match in both structures to within     0.0010
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
现在纠结问题究竟出在什么地方了？大家帮忙分析分析
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1楼 2013-05-02 11:34:13
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
14楼: Originally posted by laury at 2019-04-21 16:16:52
Setting up periodic cell information

Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
Error: Fixed coordinate mismatch:    0.000000   0.001581
Error: Fixed coordinates should match in both stru ...

固定的部分匹配偏差比程序本身的标准稍高了一点，看看能否直接删除反应物或产物其中一个固定的部分，把另一个结构固定的部分贴过来重新优化一下再重新匹配。
赞一下 回复此楼
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
15楼2019-04-21 16:49:32
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qj1989630

银虫 (小有名气)
自己顶一下，了解的给分析分析
赞一下 回复此楼
2楼2013-05-02 20:30:57
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rik203

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by qj1989630 at 2013-05-02 20:30:57
自己顶一下，了解的给分析分析

请问您这个问题解决了吗？怎么解决的呢呵呵。我也遇到了同样的问题呢
赞一下 回复此楼
岂能尽如人意，但求竭尽所能
3楼2013-08-03 20:47:55
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a94259425

木虫 (小有名气)
请问您这个问题解决了吗？求解。。。
赞一下 回复此楼
4楼2014-03-19 11:23:10
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