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qj1989630

银虫 (小有名气)

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专业: 理论和计算化学

[求助] TS confirmation无法进行，求大牛指导已有1人参与

TS confirmation提交后，马上就失败，显示以下原因
Error: Molecular superposition and fix atoms are incompatible
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
目前考虑是不是我在搜索过渡态前原子配对时没有勾选superimpose structures有关，可是在勾选时TS Search时就不能进行，又显示以下错误
Error: Fixed coordinate mismatch: 70.958090 70.889874
Error: Fixed coordinates should match in both structures to within 0.0010
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
现在纠结问题究竟出在什么地方了？大家帮忙分析分析

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1楼 2013-05-02 11:34:13

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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

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注册: 2011-08-16
性别: GG
专业: 金属材料的磨损与磨蚀
管辖: 第一性原理

引用回帖:

14楼: Originally posted by laury at 2019-04-21 16:16:52
Setting up periodic cell information

Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
Error: Fixed coordinate mismatch: 0.000000 0.001581
Error: Fixed coordinates should match in both stru ...

固定的部分匹配偏差比程序本身的标准稍高了一点，看看能否直接删除反应物或产物其中一个固定的部分，把另一个结构固定的部分贴过来重新优化一下再重新匹配。