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飞鸟知世

铜虫 (初入文坛)

[求助] 菜鸟问题：怎么利用轨道系数得出电子密度

加了命令pop=reg，计算出了分子轨道系数，求高手告知我再该怎么得出电子密度frontier electron densities ？下面是部分输出文件：
Molecular Orbital Coefficients:
                          65        66        67        68        69
                           O         O         O         O         O
     Eigenvalues --    -0.31685  -0.30450  -0.26483  -0.23931  -0.19272
   1 1   C  1S         -0.00063  -0.00070  -0.00017  -0.00004  -0.00015
   2        2S          0.00141   0.00207   0.00013   0.00060   0.00025
   3        3S         -0.00568  -0.00400   0.00339  -0.00187   0.00253
   4        4PX         0.00192   0.00141  -0.00094   0.00548  -0.00600
   5        4PY         0.00096   0.00296   0.00150  -0.00524   0.00773
   6        4PZ         0.00216  -0.04068  -0.06084   0.26001  -0.31968
   7        5PX         0.01001   0.00397   0.00103  -0.00038  -0.00168
   8        5PY         0.02190   0.01393   0.00554  -0.00545   0.00465
   9        5PZ         0.00222  -0.01515  -0.01108   0.08068  -0.11907
  10 2   C  1S          0.00046   0.00085  -0.00014   0.00005   0.00001
  11        2S         -0.00115  -0.00194   0.00026   0.00029   0.00006
  12        3S          0.00130   0.00271  -0.00086  -0.00331  -0.00164
  13        4PX        -0.00338  -0.00679  -0.00266   0.00608   0.00075
  14        4PY         0.00113   0.00429   0.00358  -0.00729  -0.00094
  15        4PZ         0.01016  -0.14543  -0.15369   0.31745   0.03401
  16        5PX        -0.01819  -0.01102  -0.00358   0.00445  -0.00135
  17        5PY         0.01590   0.01141   0.00354  -0.00304   0.00058
  18        5PZ         0.00190  -0.03244  -0.03576   0.12430  -0.01261
  19 3   C  1S          0.00017  -0.00066   0.00019   0.00004   0.00013
  20        2S         -0.00018   0.00223  -0.00046   0.00052  -0.00032
  21        3S         -0.00312  -0.00671  -0.00042  -0.00354   0.00012
  22        4PX         0.00349   0.00043  -0.00433   0.00205   0.00583
  23        4PY        -0.00093   0.00995   0.00332  -0.00223  -0.00781
  24        4PZ         0.02765  -0.29815  -0.17640   0.10526   0.31589
  25        5PX        -0.01299  -0.00875  -0.00865  -0.00259   0.00080
  26        5PY        -0.01426  -0.01022   0.00445   0.00063  -0.00251
  27        5PZ         0.00995  -0.11691  -0.09460   0.04185   0.19318
  28 4   C  1S          0.00172   0.00120  -0.00047  -0.00012  -0.00037
  29        2S         -0.00407  -0.00321   0.00133   0.00087   0.00112
  30        3S         -0.00114   0.00941  -0.00138  -0.00200  -0.00090
  31        4PX        -0.01666  -0.01786   0.00195  -0.00625   0.00122
  32        4PY         0.00890   0.00743   0.00066   0.00766   0.00033
  33        4PZ         0.02852  -0.21948   0.01396  -0.27546   0.04613
  34        5PX        -0.07277  -0.03995   0.00620   0.01293   0.00154
  35        5PY         0.03315   0.00088  -0.00893  -0.01473  -0.00077
  36        5PZ         0.01306  -0.06867   0.01481  -0.09475   0.00334
  37 5   C  1S         -0.00207  -0.00048  -0.00072  -0.00022  -0.00016
  38        2S          0.00298   0.00016   0.00156   0.00070   0.00023
  39        3S          0.02504   0.01032   0.00518   0.00087   0.00309
  40        4PX         0.01175   0.00546   0.01000  -0.00025  -0.00141
  41        4PY        -0.00665   0.00308  -0.00750   0.00265   0.00234
  42        4PZ         0.00542  -0.07995   0.37800  -0.08731  -0.12542
  43        5PX         0.04308   0.01959   0.00575  -0.01096  -0.00142
  44        5PY         0.08205   0.02548  -0.00984  -0.02429   0.00251
  45        5PZ         0.00526  -0.03600   0.17769  -0.03461  -0.05966
  46 6   C  1S          0.00182   0.00112   0.00024   0.00028   0.00026
  47        2S         -0.00378  -0.00230  -0.00068  -0.00035  -0.00053
  48        3S         -0.01408  -0.00632  -0.00243  -0.00186  -0.00366
  49        4PX        -0.01235  -0.00532  -0.00163  -0.00073  -0.00600
  50        4PY         0.00204  -0.00257   0.00040  -0.00083   0.00514
  51        4PZ        -0.01851   0.10374  -0.00476   0.05015  -0.24389
  52        5PX         0.01002   0.00646   0.00569  -0.00487  -0.00078
  53        5PY        -0.01124  -0.00395   0.00407   0.00236   0.00393
  54        5PZ        -0.00693   0.02709  -0.03312   0.03181  -0.13292
  55 7   C  1S         -0.00179  -0.00039   0.00056   0.00018   0.00028
  56        2S          0.00552   0.00215  -0.00119  -0.00009  -0.00069
  57        3S         -0.03226  -0.00994  -0.00512  -0.00088  -0.00071
  58        4PX         0.01560   0.01581  -0.00543  -0.00243  -0.00417
  59        4PY        -0.02128   0.00045   0.00180   0.00498   0.00309
  60        4PZ         0.00394   0.10988  -0.17500  -0.21699  -0.18391
  61        5PX        -0.08508  -0.00529  -0.00548   0.01633  -0.00807
  62        5PY        -0.02553  -0.01105   0.00639   0.00331   0.00399
  63        5PZ        -0.00093   0.01657  -0.07347  -0.13190  -0.08430
  64 8   C  1S          0.00027  -0.00172   0.00008  -0.00075  -0.00038
  65        2S         -0.00516   0.00230   0.00036   0.00189   0.00144
  66        3S          0.06614   0.02480  -0.00596   0.00309  -0.00262
  67        4PX         0.01011   0.02027   0.00362   0.01036   0.00719
  68        4PY        -0.01039  -0.01964   0.00360  -0.00210   0.00216
  69        4PZ        -0.02329   0.12066   0.11816   0.25071   0.24158
  70        5PX         0.04858   0.03367  -0.00519  -0.02367  -0.00631
  71        5PY        -0.05002  -0.02538   0.00384   0.02058  -0.00122
  72        5PZ         0.00064  -0.01303   0.04953   0.07794   0.10841
  73 9   C  1S          0.00399   0.00369   0.00024   0.00130   0.00051
  74        2S         -0.00746  -0.00728  -0.00102  -0.00257  -0.00111
  75        3S         -0.05138  -0.02344   0.00069  -0.01099  -0.00658
  76        4PX        -0.02467  -0.02456   0.00566  -0.00361   0.00149
  77        4PY         0.00223   0.00476  -0.00181   0.00054  -0.00053
  78        4PZ        -0.00066   0.01736   0.30226   0.13989   0.19447
  79        5PX         0.07190   0.01815   0.00275  -0.03170   0.00337
  80        5PY         0.02677   0.01486  -0.00199  -0.00671   0.00044
  81        5PZ        -0.00925   0.03205   0.07976   0.04400   0.09680
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1楼 2013-04-22 10:54:36
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飞鸟知世

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2013-04-23 10:26:11
从计算出的分子轨道系数，找到你要的frontier electron 的MO序号，将计算得到的fch文件读入multiwfn程序中，选择将frontier electron 的MO序号的作出electron densities 来。然后在作图软件中看densitie图。
...

非常感谢楼上的回复，我有找到.chk 文件，和你说的“计算得到的fch文件”是一样的吗？如果不是请问怎么找到你说的.fch文件？
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4楼2013-04-24 11:27:19
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
飞鸟知世: 金币+8 2013-04-27 12:24:05
从计算出的分子轨道系数，找到你要的frontier electron 的MO序号，将计算得到的fch文件读入multiwfn程序中，选择将frontier electron 的MO序号的作出electron densities 来。然后在作图软件中看densitie图。

[ Last edited by zhou2009 on 2013-4-23 at 10:27 ]
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2楼2013-04-23 10:26:11
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飞鸟知世

铜虫 (初入文坛)
非常感谢楼上的回复，我有找到.chk 文件，和你说的“计算得到的fch文件”是一样的吗？如果不是请问怎么找到你说的.fch文件？
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3楼2013-04-24 11:26:26
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zhouwohua

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+2 2013-04-24 21:06:09
飞鸟知世: 金币+2 2013-04-27 12:24:12
引用回帖:
4楼: Originally posted by 飞鸟知世 at 2013-04-24 11:27:19
非常感谢楼上的回复，我有找到.chk 文件，和你说的“计算得到的fch文件”是一样的吗？如果不是请问怎么找到你说的.fch文件？...

fch不是chk文件，你可以在linux系统中输入命令formchk 文件名.chk生成fch文件。
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学无止境；天天学习；努力向上。
5楼2013-04-24 13:23:02
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