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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 小麦与大麦，比较基因组
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yangjianchen

铜虫 (小有名气)

[求助] 小麦与大麦，比较基因组

请问知道一段小麦序列，如何找这段序列在大麦物理图谱中的位置？然后再映射回小麦的染色体上？
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1楼 2013-04-21 16:36:40
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yangjjzl

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-07-21 08:16:00
你可以把这段序列在NCBI上做blast比对，找出比对得到的大麦序列，查看这段序列的位置，然后回大麦序列物理图谱上找。
至于小麦序列位置，也可以通过同样方法得到
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2楼2013-07-17 10:01:16
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yangjianchen

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yangjjzl at 2013-07-17 10:01:16
你可以把这段序列在NCBI上做blast比对，找出比对得到的大麦序列，查看这段序列的位置，然后回大麦序列物理图谱上找。
至于小麦序列位置，也可以通过同样方法得到

大麦我晓得。小麦有详细的contig做的物理图谱吗？
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3楼2013-07-18 19:53:54
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