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emanlee木虫 (小有名气)
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fastq format 格式代表什么意思
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我查阅了RNA-Seq fastq format 格式的文章（包括Wiki），都没有介绍以下第一行中的这种格式的文献， 请问，其中的第一行中的1代表什么意思（以下从NCBI sra下载）？ @SRR064346.723 612W1AAXX_4:1:1348:3264 length=76 GCAAGATGTACACGAGCGACAAGCTGCACTGTGAACCCGGGCACTCCGTGCCGTCGCCACCGGCCCGCG GGTCTCT +SRR064346.723 612W1AAXX_4:1:1348:3264 length=76 BBB>BBBBABB@BBAB>@?B<@@@>BB9BB;;?  B@B>>@BBB9BBB<@BB@BA@BB?BB;>B@B>@A3*1;7;B |
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【答案】应助回帖
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| 感觉612W1AAXX_4的4应该单独看的，属于flowcell lane,1是number within flowcell lane，参看http://en.wikipedia.org/wiki/FASTQ_format，或者你少给了一个位置 |
4楼2013-04-19 07:48:23
wizardfan
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