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shelly9018

新虫 (小有名气)

[求助] 要在环境中确定某种物质的产生，与哪些类群的菌群有关系，要用到什么技术和方法呢？

要在环境中确定某种物质的产生，与哪些类群的菌群有关系，要用到什么技术和方法呢？
    现在我研究的物质产生的代谢过程是在厌氧中产生的，途径比较多且主要途径也不明朗，也不是像硝化、硫化研究比较多又比较清楚代谢类型，主要就是想做水体中一些挥发性物质的产生与什么细菌类群有关，也不需要到很清楚的种类，但是不知道怎样能有比较强的证据与说服力去说明这种物质的产生与动态变化受哪些存在类群的影响？
请各位帮帮忙，或者有类似研究物质产生与环境微生物种群关系的文献就更好了，谢谢啦！！！
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1楼2013-04-16 19:10:01
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_小小鸟

金虫 (正式写手)

御林军

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
shelly9018: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-04-18 11:34:47
楼主的问题我之前也遇到过，但是和您的不是很相关，只能提高思路供您参考了。
必需明确两个问题：1、你所谓的挥发性物质有哪些；2、水体样品里的微生物菌群都有哪些菌，做个文库就知道了。
之后可以在针对挥发物质在海量文献里找到相关报道，与你的菌群种类进行对比，推测一下，再进行相关基因的扩增，这样一来还是很有说服力的，工作量很大呢~~~
才疏学浅，只能说这么多了，希望对您有帮助
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一米阳光照大地。。。
2楼2013-04-16 19:40:30
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贤愚Libra

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我没有实践经验，只是发表一下自己的见解，希望会对你有帮助。
你的挥发性物质是混合物还是比较单一的物质，如果是单一物质就好办了，如楼上所说，查阅这个物质的相关文献，寻找突破口。
如果是混合物，也许可以做一下目的物质产生前后或其产生量变化前后菌群的变化，可以用PLFA或DGGE等技术。
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www------sr-------------
3楼2013-04-17 21:51:25
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shelly9018

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by _小小鸟 at 2013-04-16 19:40:30
楼主的问题我之前也遇到过，但是和您的不是很相关，只能提高思路供您参考了。
必需明确两个问题：1、你所谓的挥发性物质有哪些；2、水体样品里的微生物菌群都有哪些菌，做个文库就知道了。
之后可以在针对挥发物质 ...

挥发性物质的种类可以确定，而且也可以只关注最主要的几种，现在的问题我觉得实验室里用的DGGE技术很难确定到种类啊，只能确定到比较大的类群，而从文献中找到的信息是没有关于大的类群上分析的，只有室内条件下鉴定下的一些种类，这样我的在生态水平上利用数据找出来的关联性怕说服力不够
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4楼2013-04-18 11:32:40
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shelly9018

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 贤愚Libra at 2013-04-17 21:51:25
我没有实践经验，只是发表一下自己的见解，希望会对你有帮助。
你的挥发性物质是混合物还是比较单一的物质，如果是单一物质就好办了，如楼上所说，查阅这个物质的相关文献，寻找突破口。
如果是混合物，也许可以做 ...

挥发性物质的种类可以确定，而且也可以只关注最主要的几种，现在的问题我觉得实验室里用的DGGE技术很难确定到种类啊，只能确定到比较大的类群，而从文献中找到的信息是没有关于大的类群上分析的，只有室内条件下鉴定下的一些种类，这样我的在生态水平上利用数据找出来的关联性怕说服力不够
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5楼2013-04-18 11:34:41
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shelly9018

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by _小小鸟 at 2013-04-16 19:40:30
楼主的问题我之前也遇到过，但是和您的不是很相关，只能提高思路供您参考了。
必需明确两个问题：1、你所谓的挥发性物质有哪些；2、水体样品里的微生物菌群都有哪些菌，做个文库就知道了。
之后可以在针对挥发物质 ...

非常感谢你，有没有这类思路的文献给我参考下啊，因为是个新手，还没有开始做实验，所以很多东西都不了解该如何进行
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6楼2013-04-18 11:38:33
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