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tandz木虫 (正式写手)
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如何拟合morse potential的参数?
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| 结合能E与距离r 已知. 请教各位，如何写个script拟合morse potential E(r) = D*(1-exp(a*(r-rm))^2的参数 D, a, rm呢? 本人几乎没有编程水平，请大家帮忙，非常感谢！ |
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tandz: 金币+50, ★★★很有帮助, 太感谢了！ 2013-04-04 17:03:15
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MATLAB代码可以吗？ 假如已经获得了一组r，E的数据： r：1 2 3 9 E：1 5 8 18 MATLAB程序如下，结果见附图1。 function feixianxingnihe clear all;clc format long tspan=[1 2 3 9]; %r的数据，在此输入 xexp=[1 5 8 18]; %E的数据，在此输入 k0=[1 1 1]; lb=-[1 1 1]*1e5; ub=[1 1 1]*1e5; %------------------------------------------------------------------------- % 使用函数lsqnonlin()进行参数估计 OPTIONS=optimset('MaxFunEvals',1000); [k,resnorm,residual,exitflag,output,lambda,jacobian] = ... lsqnonlin(@ObjFunc,k0,lb,ub,OPTIONS,tspan,xexp); ci = nlparci(k,residual,jacobian); %residual; fprintf('\n\n使用函数lsqnonlin()估计得到的参数值为:\n') fprintf('\n\t参数 D = %.16f',k(1)) fprintf('\n\t参数 a = %.16f',k(2)) fprintf('\n\t参数rm = %.16f',k(3)) y=KineticsEqs(tspan,k); R2=1-sum((xexp-y).^2)./sum((xexp-mean(y)).^2); fprintf('\n\t相关系数之平方R^2 = %.16f',R2); figure plot(tspan,KineticsEqs(tspan,k),'b',tspan,xexp,'or'),legend('计算值','实验值','Location','Best') %------------------------------------------------------------------------- function f = ObjFunc(k,tspan,xexp) f=KineticsEqs(tspan,k)-xexp; %------------------------------------------------------------------------ function xt = KineticsEqs(t,k) xt=k(1)*(1-exp(k(2).*(t-k(3)))).^2; 做方程拟合，1stopt代码简单易懂，1stopt代码如下： Parameters D,a,rm; Variable r,E; Function E=D*(1-exp(a*(r-rm)))^2; Data; 1 1 2 5 3 8 9 18 计算结果见附图2。 可以看到两种方法计算结果相当接近。  附图1.jpg  附图2.jpg |
5楼2013-04-04 16:27:04
dingd
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2楼2013-04-03 10:15:16
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6楼2013-04-04 17:06:25
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7楼2013-04-06 16:06:21
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tandz8楼2013-04-06 18:08:39
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