应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 为什么此作业提交不了？segmentation violation错误
111/2返回列表12下一页
查看: 2435  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

luyang_982

新虫 (小有名气)

[求助] 为什么此作业提交不了？segmentation violation错误

今天提交一个作业，总是出现下面的错误。提交别的作业又可以，这是为什么啊？

Error: segmentation violation
   rax 0000000000000000, rbx ffffffffffffffff, rcx ffffffffffffffff
   rdx 0000000000004467, rsp 00007ffff3095258, rbp 00007ffff3095830
   rsi 000000000000000b, rdi 0000000000004467, r8  00002acbf3f49b90
   r9  0000000000000000, r10 0000000000000000, r11 0000000000000202
   r12 0000000000000000, r13 0000000000000000, r14 00007ffff3095878
   r15 0000000000000000
  --- traceback not available

输入文件
%chk=OptTsH2802.chk
%mem=1GB
%nprocshared=8
#p opt=modredundant freq m052x/6-311++g(d,p) iop(1/11=1,2/16=1,5/13=1) optcyc=100

OptTsH2802

0 2
C
C                  1            B1
C                  2            B2    1            A1
C                  3            B3    2            A2    1            D1    0
C                  4            B4    3            A3    2            D2    0
C                  1            B5    2            A4    3            D3    0
H                  2            B6    1            A5    6            D4    0
H                  4            B7    3            A6    2            D5    0
H                  6            B8    1            A7    2            D6    0
C                  3            B9    2            A8    1            D7    0
C                 10           B10    3            A9    2            D8    0
C                 10           B11    3           A10    2            D9    0
C                 11           B12   10           A11    3           D10    0
H                 11           B13   10           A12    3           D11    0
C                 12           B14   10           A13    3           D12    0
H                 12           B15   10           A14    3           D13    0
C                 13           B16   11           A15   10           D14    0
H                 13           B17   11           A16   10           D15    0
H                 10           B18    3           A17    2           D16    0
C                 10           B19    3           A18    2           D17    0
C                 20           B20   10           A19    3           D18    0
H                 21           B21   20           A20   10           D19    0
O                  5           B22    4           A21    3           D20    0
H                 23           B23    5           A22    4           D21    0
O                  1           B24    2           A23    3           D22    0
H                 25           B25    1           A24    2           D23    0
O                 15           B26   12           A25   10           D24    0
H                 27           B27   15           A26   12           D25    0
O                 17           B28   13           A27   11           D26    0
H                 29           B29   17           A28   13           D27    0
O                 20           B30   10           A29    3           D28    0
H                 20           B31   10           A30    3           D29    0

   B1             1.38707260
   B2             1.39543272
   B3             1.39685746
   B4             1.38449294
   B5             1.39003474
   B6             1.08061531
   B7             1.07929992
   B8             1.08433153
   B9             3.87152233
   B10            1.39663419
   B11            1.39833821
   B12            1.38800180
   B13            1.07987406
   B14            1.38286633
   B15            1.08178925
   B16            1.38490436
   B17            1.08344505
   B18            2.16120898
   B19            1.46737116
   B20            1.33682384
   B21            1.08382963
   B22            1.36377757
   B23            0.95860732
   B24            1.36332288
   B25            0.95865629
   B26            1.25000000
   B27            1.00000000
B28            1.37208873
   B29            0.95852374
   B30            7.35610950
   B31            7.43770541
   A1           119.94861989
   A2           119.69662260
   A3           119.56122379
   A4           120.80226058
   A5           118.91304727
   A6           122.04978598
   A7           120.64014538
   A8           133.68235092
   A9           107.52007728
   A10          133.65386699
   A11          120.48152987
   A12          120.41457594
   A13          121.08721801
   A14          120.74991969
   A15          120.11995277
   A16          120.25618587
   A17           43.06564878
   A18           16.02338257
   A19          125.96787541
   A20          119.53589191
   A21          117.29855686
   A22          110.06674150
   A23          117.35554598
   A24          110.01719099
   A25          120.06874544
   A26          108.46256347
   A27          124.47215623
   A28          110.57139783
   A29           17.15512911
   A30           19.84279425
  D1            -1.08905111
   D2             1.12109019
   D3             0.38320371
   D4           179.66912964
   D5          -177.33275018
   D6           179.58945077
   D7           172.37061184
   D8            35.39150076
   D9          -139.39905579
   D10         -174.61653196
   D11            6.74639462
   D12          173.25185961
   D13           -6.14416953
   D14           -0.38453312
   D15         -179.61863388
   D16         -157.54398869
   D17         -158.84034211
   D18            0.05550172
   D19            2.53877873
   D20         -179.92858968
   D21          179.13578103
   D22         -179.67697512
   D23          179.02579962
   D24         -179.66299735
   D25          179.60892707
   D26         -179.75155874
   D27           -0.50188323
  D28          155.05713500
   D29          132.83393818

1 2 1.5 6 1.5 25 1.0
2 3 1.5 7 1.0
3 4 1.5 21 1.0
4 5 2.0 8 1.0
5 6 1.5 23 1.0
6 9 1.0
7
8
9
10 11 1.5 12 1.5 20 1.0
11 13 1.5 14 1.0
12 15 2.0 16 1.0
13 17 2.0 18 1.0
14
15 17 1.5 27 2.0
16
17 29 1.0
18
19 20 1.0
20 21 2.0
21 22 1.0
22
23 24 1.0
24
25 26 1.0
26
27 28 1.0
28
29 30 1.0
30
31 32 1.0
32

B 15 27 F
B 27 28 F
B 28 31 F
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-03-27 21:19:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luyang_982

新虫 (小有名气)
请各位大侠帮帮忙！
赞一下 回复此楼
2楼2013-03-28 08:18:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luyang_982

新虫 (小有名气)
刚看了下结果文件是这个错误：
Error termination via Lnk1e in /home/g09/l101.exe at Thu Mar 28 09:29:18 2013
赞一下 回复此楼
3楼2013-03-28 08:45:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

医无止境

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
luyang_982: 金币+6, ★★★★★最佳答案 2013-03-29 08:32:11
把“1 2 1.5 6 1.5 25 1.0”开始往后的这些行去掉再算试试
赞一下 回复此楼
4楼2013-03-28 16:43:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qzhost

木虫 (小有名气)
楼上正解
回复此楼
5楼2013-03-29 07:47:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luyang_982

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 医无止境 at 2013-03-28 16:43:40
把“1 2 1.5 6 1.5 25 1.0”开始往后的这些行去掉再算试试

恩，是的。非常正确，谢谢！
赞一下 回复此楼
6楼2013-03-29 08:33:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

迟小二儿

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by luyang_982 at 2013-03-29 08:33:20
恩，是的。非常正确，谢谢！...

%chk=PFPFP.chk
%mem=125MW
%nproc=8
#p td=(nstates=20) rb3lyp/6-311g(d,p) geom=connectivity test

PFPFP

  0  1
C 0   14.906425    8.016671   -1.987922
C 0   14.848539    9.376503   -1.676869
C 0   15.928039   10.028818   -1.061784
C 0   17.100804    9.289413   -0.818523
C 0   17.168296    7.929936   -1.125942
C 0   16.057528    7.279463   -1.695629
S 0   18.708087    7.051369   -0.734934
C 0   18.332281    5.360780   -1.275852
C 0   17.084462    4.993105   -1.817089
N 0   16.045846    5.913039   -1.995174
C 0   19.355940    4.417427   -1.198799
C 0   19.140799    3.112596   -1.660966
C 0   17.894979    2.738145   -2.160418
C 0   16.859531    3.675993   -2.228298
C 0   16.624593   12.197892    0.027667
C 0   15.747451   11.431802   -0.667379
C 0   20.146766    2.037738   -1.389151
C 0   20.295182    0.700773   -1.461547
C 0   29.705057   -9.720246   -0.724733
C 0   28.878893   -8.594485   -0.674777
C 0   29.380665   -7.340139   -0.296530
C 0   30.749985   -7.246223    0.020750
C 0   31.583341   -8.364907   -0.023831
C 0   31.061197   -9.616957   -0.398640
S 0   33.331790   -8.134595    0.412524
C 0   34.005527   -9.810365    0.229441
C 0   33.212875  -10.902661   -0.175494
N 0   31.845684  -10.775978   -0.460801
C 0   35.360638  -10.001281    0.504276
C 0   35.934404  -11.273140    0.375474
C 0   35.153635  -12.353138   -0.028040
C 0   33.793351  -12.168812   -0.302942
C 0    9.372652   28.251641    5.786501
C 0    9.863312   29.359051    6.487761
C 0   11.175310   29.359251    6.954230
C 0   12.007395   28.256387    6.718052
C 0   11.528828   27.152141    6.011194
C 0   10.199050   27.149465    5.545313
S 0   12.662931   25.759522    5.732786
C 0   11.657422   24.630619    4.725302
C 0   10.310193   24.907500    4.419492
N 0    9.659382   26.077847    4.824599
C 0   12.255484   23.469220    4.235945
C 0   11.539151   22.563761    3.426050
C 0   10.179920   22.818076    3.200417
C 0    9.573719   23.985624    3.673427
C 0   27.240650   -6.036036   -0.540177
C 0   13.335103   20.865666    3.195158
C 0   12.155130   21.386979    2.786886
C 0   28.551958   -6.128435   -0.208251
C 0   15.363722   19.517821    3.049509
C 0   14.015553   19.674152    2.668332
C 0   13.380704   18.669748    1.914609
C 0   14.093883   17.520748    1.567430
C 0   15.425107   17.397494    1.978515
C 0   16.089968   18.382970    2.705431
C 0   13.602227   16.299422    0.800372
C 0   14.869714   15.456689    0.865674
C 0   15.911400   16.101911    1.541396
C 0   15.094766   14.184734    0.344355
C 0   16.352071   13.562440    0.507159
C 0   17.368254   14.249375    1.198846
C 0   17.162482   15.522525    1.726713
C 0   12.430459   15.616118    1.518143
C 0   13.241733   16.658115   -0.647557
C 0   22.629988    0.545199   -0.506109
C 0   21.479302   -0.061127   -1.045504
C 0   21.448531   -1.450579   -1.248730
C 0   22.592230   -2.201739   -0.987559
C 0   23.742354   -1.561126   -0.514176
C 0   23.781423   -0.193587   -0.244799
C 0   22.771201   -3.699193   -1.168245
C 0   24.243327   -3.790838   -0.802527
C 0   24.789545   -2.563564   -0.407679
C 0   25.058179   -4.917638   -0.829512
C 0   26.418494   -4.818501   -0.467459
C 0   26.931470   -3.566278   -0.079585
C 0   26.125970   -2.426739   -0.042373
C 0   21.902357   -4.483286   -0.175227
C 0   22.508293   -4.127030   -2.617583
H 0   14.032928    7.523931   -2.445406
H 0   13.913311    9.918390   -1.893645
H 0   17.978035    9.766537   -0.357365
H 0   15.162283    5.537238   -2.419941
H 0   20.362995    4.706943   -0.856579
H 0   17.743992    1.728184   -2.575305
H 0   15.892145    3.385185   -2.668784
H 0   17.602168   11.771335    0.299324
H 0   14.769559   11.858934   -0.932743
H 0   20.925067    2.715532   -1.008870
H 0   19.440825    0.123150   -1.857762
H 0   29.279545  -10.692991   -1.020823
H 0   27.814542   -8.716057   -0.935854
H 0   31.193660   -6.282468    0.310344
H 0   31.350721  -11.654657   -0.752830
H 0   35.994113   -9.157764    0.824096
H 0   37.005061  -11.418563    0.592530
H 0   35.605388  -13.353017   -0.130683
H 0   33.182406  -13.029309   -0.620888
H 0    8.334821   28.259092    5.415103
H 0    9.212029   30.229958    6.666008
H 0   11.560870   30.231063    7.507111
H 0   13.042876   28.275558    7.095126
H 0    8.657041   26.176506    4.527946
H 0   13.316147   23.269239    4.460531
H 0    9.542381   22.123105    2.633933
H 0    8.512768   24.178581    3.444011
H 0   26.727699   -6.937658   -0.907758
H 0   13.853472   21.355796    4.033655
H 0   11.609400   20.897761    1.964517
H 0   29.066891   -5.226262    0.155404
H 0   15.872199   20.288507    3.652361
H 0   12.319913   18.743040    1.633558
H 0   17.136211   18.258394    3.022344
H 0   14.281535   13.682716   -0.202552
H 0   18.373062   13.827891    1.343018
H 0   17.963752   16.052979    2.263189
H 0   12.136380   14.674186    1.001976
H 0   11.532823   16.274904    1.541171
H 0   12.691301   15.360777    2.570300
H 0   12.965529   15.749939   -1.229995
H 0   14.094518   17.149624   -1.168746
H 0   12.373634   17.354831   -0.684928
H 0   22.650057    1.630481   -0.313383
H 0   20.546903   -1.964494   -1.611452
H 0   24.692469    0.290138    0.138659
H 0   24.622932   -5.877570   -1.148037
H 0   27.988465   -3.431496    0.192615
H 0   26.537830   -1.446481    0.242888
H 0   22.114594   -5.574997   -0.230062
H 0   20.818471   -4.342281   -0.388110
H 0   22.085937   -4.154955    0.873251
H 0   22.714697   -5.211354   -2.761971
H 0   21.446117   -3.952913   -2.902889
H 0   23.148045   -3.558785   -3.330381

我的没有那些数字也是出现同样的错误怎么回事呢[cxc@zhz ~]$ ./run: line 1: cd: /home/cxc/PFPFP: 没有那个文件或目录
Error: segmentation violation
   rax 0000000000000000, rbx ffffffffffffffff, rcx ffffffffffffffff
   rdx 00000000000060c2, rsp 00007fff22785638, rbp 00007fff22785c10
   rsi 000000000000000b, rdi 00000000000060c2, r8  00002ab34f7e9160
   r9  0000000000000000, r10 00007fff227853c0, r11 0000000000000202
   r12 0000000000000000, r13 0000000000000000, r14 00007fff22785c58
   r15 0000000000000087
  0  0x380c632d27
  1  0x44aea5  lnk1e_ + 0x225
  2  0x4449d0  gauerr_ + 0x80
  3  0x4144e5  docon_ + 0x605
  4  0x405ff1  rdgeom_ + 0x28c1
  5  0x403710  MAIN_ + 0xb0
  6  0x403648
求帮助
赞一下 回复此楼
7楼2013-04-10 13:54:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luyang_982

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 迟小二儿 at 2013-04-10 13:54:31
%chk=PFPFP.chk
%mem=125MW
%nproc=8
#p td=(nstates=20) rb3lyp/6-311g(d,p) geom=connectivity test

PFPFP

  0  1
C 0   14.906425    8.016671   -1.987922
C 0   14.848539    9.376503   -1.676 ...

你的没有那些数字，是不是就应该把 geom=connectivity 去掉啊。另外你看一下log文件，应该能查到错误在哪里。
赞一下 回复此楼
8楼2013-04-10 14:23:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

迟小二儿

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by luyang_982 at 2013-04-10 14:23:45
你的没有那些数字，是不是就应该把 geom=connectivity 去掉啊。另外你看一下log文件，应该能查到错误在哪里。...

我没有去掉那个，不知道怎么样就解决了这个问题，现在非常的想知道怎么看log文件，怎么生成的？log文件时gauss sum的输入文件吧，我想算差分态密度，高手能否指教一二？先谢谢您
赞一下 回复此楼
9楼2013-04-12 09:11:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luyang_982

新虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 迟小二儿 at 2013-04-12 09:11:56
我没有去掉那个，不知道怎么样就解决了这个问题，现在非常的想知道怎么看log文件，怎么生成的？log文件时gauss sum的输入文件吧，我想算差分态密度，高手能否指教一二？先谢谢您...

我也是个新手，呵呵。log文件应该是结果文件吧，我是在linux系统里面操作的，提交完作业后自动生成和作业名相同的.log文件，然后我在那里查看的。

差分态密度我没算过，所以不太清楚。
赞一下 回复此楼
10楼2013-04-12 09:55:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 luyang_982 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭