应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 系统发育树的建立和分析
162/2返回列表上一页12
查看: 3568  |  回复: 15
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

201014162

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by lcat at 2013-03-28 13:59:47
我觉得还是要按NCBI的来吧，你可以只选择各自得分最高的一条放进来啊。不然确实给人下面这一大支全都是新物种的感觉...

恩  我再重做一下
回复此楼
生命在于奋斗
11楼2013-03-29 09:51:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

201014162

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by yang1279 at 2013-03-28 14:29:58
楼主要说清楚是用核酸还是蛋白序列做的树，还有是用什么方法做的， 我觉得可能你的alignment有些问题

我做的是核酸，用的Mega上的邻位相连法
赞一下 回复此楼
生命在于奋斗
12楼2013-03-29 09:53:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

201014162

金虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by rommel1941 at 2013-03-28 17:24:18
1.先说清楚你构建的是什么树，什么方法，你的标记用的是什么，长度和多态性。
2.是不是几种建树方法都一直。
3.如果你建的是有根树，外群找的是否合适。
4.你到底要说明什么问题。
   光凭一课说，基本说明不了 ...

我做的是系统发育树，用的是Mega上的邻位相连法，至于有根树还是无根树我不懂，不知道怎么给你说，建树方法我是按照木虫上提供的步骤做的。我做的是全菌序列，用的引物是F338和R518，想要鉴定一下样品中都是什么种群。
谢谢！
赞一下 回复此楼
生命在于奋斗
13楼2013-03-29 09:58:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
201014162: 金币+5, ★★★很有帮助, 多谢 2013-03-31 16:38:56
N-J法的好处就是算法比较简单，不过需要一个很好的外群，才会有很好的拓扑结构出现。
建议你使用Phylip这个软件来算N-J树。如果你老师要求不严格，这一个数可以交差了，不过凭一个树下结论，有点牵强。
祝好！
赞一下 回复此楼
将相本无种★男儿当自强
14楼2013-03-30 14:49:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

denysa

新虫 (初入文坛)
楼主问题解决了吗？我也遇到了相似问题，序列反转后画出来还是一样，求助啊
赞一下 回复此楼
15楼2013-04-11 15:40:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuliaotiny

新虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 201014162 at 2013-03-29 09:50:52
好的  多谢  我试试...

我也遇到了这个问题，想像你请教一下
赞一下 回复此楼
16楼2015-12-16 17:01:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 201014162 的主题更新
162/2返回列表上一页12
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化学工程321分求调剂 +7 大米饭！ 2026-03-15 7/350 2026-03-16 10:25 by 了了了了。。
[考研] 290求调剂 +5 孔志浩 2026-03-12 10/500 2026-03-16 09:01 by 余晖&
[考研] 321求调剂 +4 大米饭！ 2026-03-15 4/200 2026-03-16 08:41 by Linda Hu
[考研] 311求调剂 +6 冬十三 2026-03-15 6/300 2026-03-16 08:00 by wang_dand
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 085601材料工程315分求调剂 +3 yang_0104 2026-03-15 3/150 2026-03-15 10:58 by peike
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化，一志愿：哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[考研] 0856材料与化工309分求调剂 +6 ZyZy…… 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:38 by JourneyLucky
[考研] 26考研调剂 +3 ying123. 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:18 by JourneyLucky
[考研] 2026考研调剂+本科延边大学+山东大学+生物化学与分子生物学+有项目经验 +3 ccdsscjy 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:12 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +5 牛乳糖的卡卡 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:05 by JourneyLucky
[考研] 0805，333求调剂 +3 112253525 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:42 by JourneyLucky
[考研] 求材料调剂 085600英一数二总分302 前三科235 精通机器学习 一志愿哈工大 +4 林yaxin 2026-03-12 4/200 2026-03-13 22:04 by 星空星月
[考研] 四川大学085601材料工程专硕 初试294求调剂 +4 祝我们好在冬天 2026-03-11 4/200 2026-03-13 21:39 by peike
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
[考研] 工科0856专硕化学工程269能调剂吗 +10 我想读研11 2026-03-10 10/500 2026-03-13 10:14 by Yuyi.
[考研] 420求调剂 +4 莫向外求11 2026-03-10 6/300 2026-03-12 14:41 by ruiyingmiao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭