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chaofan0726

新虫 (小有名气)

[交流] 用SPSS运行IC50的一些问题请教,请高手指点 已有4人参与

大家好,本人对合成出来的一些列药物进行抗癌活性测试,设了1000,500,250,125,62.5,31.25μg/ml几个梯度,有几组数据用SPSS运行后IC50值超过了1000,但在最大剂量时他的抑制率是58%,根据抑制率折线图所得的结果应该是小于1000的。
由于对生物知识了解较少,而且重新在做一次很慢反。现在想请教各位:文章中是否可以直接写运行出的数值还是写>1000?具体原因是什么?多谢各位了。
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wq0616

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小木虫资源里有一个IC50计算工具,楼主可以下一个,再试试得到的数据是不是和之前的一样。那个软件只能装在XP系统里,这个结果可能更好一些。
艰难困苦,玉汝于成。
2楼2013-03-27 10:47:55
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zjwtcm

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
Sp s s 计算的结果较为准确,但超一千了,活性就不咋的了

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2013-03-28 07:08:56
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chaofan0726

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zjwtcm at 2013-03-28 07:08:56
Sp s s 计算的结果较为准确,但超一千了,活性就不咋的了

活性不好没有关系,但我现在纠结在文章中直接写运行的数值,还是写>1000?写那个更合理一点?多谢啦!
4楼2013-03-28 09:31:44
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yangyihui1

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
如果一个化合物在最大剂量(1000)时的抑制率是58%,一般咱们会认为它的IC50值应该比1000大不了多少,接近1000.   但事实上IC50值的计算,除了与“浓度1000时-抑制率58%”有关外,还与其它几个浓度(500,250,125,62.5,31.25μg/ml)的抑制率有关。如果500,250μg/ml 的抑制率值很低,则最后计算的IC50值会非常大(别看它浓度1000时-抑制率58%,已经接近50%了)。这种情况我遇到过几次。
有个建议,我觉得你设计的浓度梯度中,最大的浓度设计的不高。当然,我不清楚你的化合物的分子量,如果分子量是100的话,最大的浓度只有10微摩/毫升。如果分子量是200的话,最大的浓度只有5微摩/毫升。所以浓度上限的设定值有些小。如果你的浓度上限设定的再高些,可能那些原来超出去的IC50会落在新的浓度范围里,这样SPSS计算的结果也会更准确。
有很多文献设定的浓度梯度为100、50、25......微摩/毫升(如果分子量是200的话,即是20000、10000、5000......微克 /毫升)
如果觉得最高浓度值设计的太高,可以再降降。

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5楼2013-03-28 10:01:19
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yangyihui1

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
补充一句,我觉得写>1000比较好

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

6楼2013-03-28 10:03:44
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chaofan0726

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by yangyihui1 at 2013-03-28 10:01:19
如果一个化合物在最大剂量(1000)时的抑制率是58%,一般咱们会认为它的IC50值应该比1000大不了多少,接近1000.   但事实上IC50值的计算,除了与“浓度1000时-抑制率58%”有关外,还与其它几个浓度(500,250,125,62 ...

多谢啦!
7楼2013-03-28 11:36:22
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chaofan0726

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by yangyihui1 at 2013-03-28 10:03:44
补充一句,我觉得写>1000比较好

好的,多谢啦!
8楼2013-03-28 11:36:37
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yangjie0512

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by zjwtcm at 2013-03-28 07:08:56
Sp s s 计算的结果较为准确,但超一千了,活性就不咋的了

请问您有SPSS软件吗可以给我分享一下不 我下载不到 谢谢了
人必得要有耐心,特别是要有信心。
9楼2015-01-18 18:24:01
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