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flyingfish00

铜虫 (正式写手)

[求助] 组个电脑跑Gaussian,SSD硬盘128G够吗?

准备组个台式机跑Gaussian,计算有机物反应过程。分子体系不算大。

初步准备上 intel i7 +华硕主板,内存16G。 这个不能再低了。

硬盘准备用固态硬盘,现在固态硬盘也不便宜,128G的也要六七百,256G的就更贵了。

想知道Gaussian普通计算的话,128G的够不够?还请指点一下。多谢。
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maynard

金虫 (初入文坛)

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★ ★ ★ ★ ★
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flyingfish00: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-03-22 09:24:08
确定要用SSD?再考虑下吧
用这种硬盘读写次数是硬伤啊,科学计算还是用稳定一些的好,买1T或多花点钱买1T*2
2楼2013-03-21 12:07:38
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flyingfish00

铜虫 (正式写手)

我也本来准备买普通硬盘的,不是看到有hairen大牛说,用ssd硬盘速度特别快么。所以就来问问。

ssd固态硬盘有读写次数,这个确实是硬伤。
3楼2013-03-21 12:09:20
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flyingfish00

铜虫 (正式写手)

有没有人用过ssd硬盘,对于普通硬盘和ssd硬盘,对于gaussian计算速度的提升能高多少?有人有此体验吗?
4楼2013-03-21 12:10:09
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emc2

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

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买多块硬盘做RAID0,SSD硬盘不行,时间长了性能就下降了。
5楼2013-03-21 14:58:17
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stalart

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用SAS服务器硬盘
6楼2013-03-21 18:30:32
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bluewhale

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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flyingfish00: 金币+5 2013-03-22 09:23:53
有的集群就用过SSD,不过是服务器版的,64GB约5000元,还不如用SAS硬盘,再多配点内存,64GB或更多,这样可将部分内存作scratch(mem)。我们后来更新的机器采用这种方案,效果很好。
7楼2013-03-21 22:59:50
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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flyingfish00: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2013-03-22 09:23:43
引用回帖:
3楼: Originally posted by flyingfish00 at 2013-03-21 12:09:20
我也本来准备买普通硬盘的,不是看到有hairen大牛说,用ssd硬盘速度特别快么。所以就来问问。

ssd固态硬盘有读写次数,这个确实是硬伤。


我什么时候成大牛了,我都不知道!

根据我理解,如果你经常跑post-HF计算,比如MP2和CCSD(T),也就是硬盘读写量非常大的那类,买ssd对计算速度的提升比较多。如果研究的体系还比较大,基函数能达到350以上,买个240G以上的ssd吧,怕个别的时候硬盘容量不够用。
买ssd也不用怕质量问题,算法的改进使得可靠读写次数在上升,要不然厂商不敢提供四五年的质保,只要计算结果及时下载下来,硬盘坏了大不了免费换一块,你再花一个小时时间装一下系统和软件就行了,为预防质保方面的问题,最好买大厂的产品。
实际上,你能用三年就算赚了,三年后SSD技术肯定成熟很多,没准普通机器都标配ssd了。我最近准备买上几台配置ssd的机器专门跑CCSD(T)计算。

如果只跑跑DFT计算,ssd和机械硬盘的区别也不是很大,DFT主要是跑CPU。
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
8楼2013-03-22 07:51:44
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
flyingfish00: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-03-22 09:23:32
引用回帖:
5楼: Originally posted by emc2 at 2013-03-21 14:58:17
买多块硬盘做RAID0,SSD硬盘不行,时间长了性能就下降了。

ssd性能下降主要是因为数据太多且存放散乱,如果算完了就把数据下载下来,然后删除ssd中的数据(类似集群中的计算节点,计算完了结果就拷贝到主节点,计算节点数据就删除了),性能下降不会很多。
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
9楼2013-03-22 07:55:08
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flyingfish00

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by hairan at 2013-03-22 07:51:44

我什么时候成大牛了,我都不知道!

根据我理解,如果你经常跑post-HF计算,比如MP2和CCSD(T),也就是硬盘读写量非常大的那类,买ssd对计算速度的提升比较多。如果研究的体系还比较大,基函数能达到350以上, ...

大牛就是大牛啊。在我心目里就是。呵呵。

您提出的评论信息量很丰富,非常有用。我就决定向你学习了!
10楼2013-03-22 09:23:23
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