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chongsleep

银虫 (小有名气)

[求助] 求助大虾:优化镨的多元氢化物出现一个虚频不知道怎么解决?

输入文件

%mem=30MW
# opt rb3lyp/gen nosymm geom=connectivity pseudo=read scfcyc=300

Title Card Required

0 1
H                  1.54737927    0.89337984    0.65853931
H                 -1.54737927    0.89337984    0.65853931
H                  0.00000000   -1.78675968    0.65853931
Pr                 0.00000000    0.00000000   -0.05191232

1 4 1.0
2 4 1.0
3 4 1.0
4

H 0
aug-cc-pvtz
****
pr 0
sdd
****
pr 0
sdd
输出文件的一部分
                   1                      2                      3
                     A                      A                      A
Frequencies -- -1337.2289               353.1483               545.5498
Red. masses --     1.0092                 1.0266                 1.0148
Frc consts  --     1.0632                 0.0754                 0.1780
IR Inten    --    61.7133               431.8142                82.8291
  Atom  AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
     1   1    -0.13  -0.48   0.08    -0.17  -0.12   0.54    -0.40   0.55   0.12
     2   1    -0.13   0.48  -0.08     0.17  -0.12   0.54     0.40   0.55   0.12
     3   1     0.70   0.00   0.00     0.00   0.21   0.54     0.00  -0.11  -0.20
     4  59     0.00   0.00   0.00     0.00   0.00  -0.01     0.00  -0.01   0.00
                     4                      5                      6
                     A                      A                      A
Frequencies --  1169.7836              1319.3966              1408.1568
Red. masses --     1.0240                 1.0183                 1.0105
Frc consts  --     0.8256                 1.0444                 1.1806
IR Inten    --  1005.0633              1061.2968               130.6870
  Atom  AN      X      Y      Z        X      Y      Z        X      Y      Z
     1   1     0.58   0.14   0.29     0.28   0.20   0.11    -0.49  -0.29  -0.21
     2   1     0.58  -0.14  -0.29    -0.28   0.20   0.11     0.49  -0.29  -0.21
     3   1     0.34   0.00   0.00     0.00   0.82  -0.29     0.00   0.47  -0.18
     4  59    -0.01   0.00   0.00     0.00  -0.01   0.00     0.00   0.00   0.00

-------------------
- Thermochemistry -
-------------------
Temperature   298.150 Kelvin.  Pressure   1.00000 Atm.
Atom     1 has atomic number  1 and mass   1.00783
Atom     2 has atomic number  1 and mass   1.00783
Atom     3 has atomic number  1 and mass   1.00783
Atom     4 has atomic number 59 and mass 140.90740
Molecular mass:   143.93088 amu.
Principal axes and moments of inertia in atomic units:
                           1         2         3
     Eigenvalues --    24.58246  25.11222  40.88422
           X            0.00000   1.00000   0.00000
           Y            1.00000   0.00000   0.00042
           Z           -0.00042   0.00000   1.00000
This molecule is an asymmetric top.
Rotational symmetry number  1.
Rotational temperatures (Kelvin)      3.52340     3.44907     2.11851
Rotational constants (GHZ):          73.41582    71.86706    44.14273
    1 imaginary frequencies ignored.
Zero-point vibrational energy      28686.7 (Joules/Mol)
                                    6.85628 (Kcal/Mol)
Warning -- explicit consideration of   2 degrees of freedom as
           vibrations may cause significant error
Vibrational temperatures:    508.10   784.92  1683.06  1898.31  2026.02
          (Kelvin)

Zero-point correction=                           0.010926 (Hartree/Particle)
Thermal correction to Energy=                    0.014346
Thermal correction to Enthalpy=                  0.015290
Thermal correction to Gibbs Free Energy=        -0.013443
Sum of electronic and zero-point Energies=           -518.687989
Sum of electronic and thermal Energies=              -518.684570
Sum of electronic and thermal Enthalpies=            -518.683626
Sum of electronic and thermal Free Energies=         -518.712358

                     E (Thermal)             CV                S
                      KCal/Mol        Cal/Mol-Kelvin    Cal/Mol-Kelvin
Total                    9.002              9.147             60.473
Electronic               0.000              0.000              0.000
Translational            0.889              2.981             40.804
Rotational               0.889              2.981             17.874
Vibrational              7.224              3.185              1.795
Vibration     1          0.729              1.569              1.152
Vibration     2          0.901              1.149              0.553
                       Q            Log10(Q)             Ln(Q)
Total Bot       0.152497D+07          6.183262         14.237486
Total V=0       0.161786D+12         11.208941         25.809541
Vib (Bot)       0.124938D-04         -4.903304        -11.290275
Vib (Bot)    1  0.521372D+00         -0.282853         -0.651292
Vib (Bot)    2  0.288887D+00         -0.539272         -1.241720
Vib (V=0)       0.132549D+01          0.122375          0.281780
Vib (V=0)    1  0.122238D+01          0.087205          0.200797
Vib (V=0)    2  0.107746D+01          0.032400          0.074603
Electronic      0.100000D+01          0.000000          0.000000
Translational   0.678713D+08          7.831686         18.033124
Rotational      0.179837D+04          3.254879          7.494637
-------------------------------------------------------------------
Center     Atomic                   Forces (Hartrees/Bohr)
Number     Number              X              Y              Z
-------------------------------------------------------------------
      1        1           0.000030634   -0.000026493    0.000015439
      2        1          -0.000030634   -0.000026493    0.000015439
      3        1           0.000000000    0.000006943   -0.000030959
      4       59           0.000000000    0.000046043    0.000000081
-------------------------------------------------------------------
Cartesian Forces:  Max     0.000046043 RMS     0.000023952

GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
Internal  Forces:  Max     0.000083082 RMS     0.000046184
Search for a local minimum.
Step number   1 out of a maximum of    2
All quantities printed in internal units (Hartrees-Bohrs-Radians)
Second derivative matrix not updated -- analytic derivatives used.
The second derivative matrix:
                          R1        R2        R3        A1        A2
           R1           0.04932
           R2           0.02368   0.04926
           R3           0.00289   0.00289   0.06829
           A1          -0.00185  -0.00186   0.00287   0.02822
           A2          -0.05858   0.05832  -0.00450  -0.02094  -0.10114
           A3           0.05824  -0.05865  -0.00448  -0.02096   0.14665
           D1          -0.00260  -0.00260  -0.00257   0.00693   0.00486
                          A3        D1
           A3          -0.10110
           D1           0.00486   0.01557
     Eigenvalues ---   -0.29094   0.02105   0.06009   0.06878   0.07251
     Eigenvalues ---    0.076941000.00000
Eigenvalue     1 is  -2.91D-01 should be greater than     0.000000 Eigenvector:
                          A2        A3        R2        R1        A1
   1                    0.66337  -0.66328  -0.24512   0.24480  -0.00005
                          R3        D1
   1                    0.00004   0.00000
Angle between quadratic step and forces=  25.11 degrees.
Linear search not attempted -- first point.
Iteration  1 RMS(Cart)=  0.00154904 RMS(Int)=  0.00000083
Iteration  2 RMS(Cart)=  0.00000067 RMS(Int)=  0.00000002
Variable       Old X    -DE/DX   Delta X   Delta X   Delta X     New X
                                 (Linear)    (Quad)   (Total)
    R1        3.86221   0.00001   0.00000   0.00027   0.00027   3.86247
    R2        3.86221   0.00001   0.00000   0.00027   0.00027   3.86247
    R3        3.89850  -0.00001   0.00000  -0.00024  -0.00024   3.89826
    A1        1.92002   0.00008   0.00000   0.00169   0.00169   1.92171
    A2        1.93457  -0.00006   0.00000  -0.00068  -0.00068   1.93389
    A3        1.93457  -0.00006   0.00000  -0.00068  -0.00068   1.93389
    D1        2.13733   0.00002   0.00000   0.00121   0.00121   2.13854
         Item               Value     Threshold  Converged?
Maximum Force            0.000083     0.000450     YES
RMS     Force            0.000046     0.000300     YES
Maximum Displacement     0.002092     0.001800     NO
RMS     Displacement     0.001549     0.001200     NO
Predicted change in Energy=-1.293237D-07
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad

出现了一个虚频,我尝试了通过Gview沿虚频振动方向调整了分子结构(0.01、0.04、0.07、0.1都试过,调整为0.07时虚频好像更负了一点点),结果优化失败。我又按照一个常用的方法,把虚频对应的振动坐标权重之后叠加到原始坐标上,结果还是失败了。。。求助各位大虾指导一下我个菜鸟,感激不尽。。。
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学习的道路上更要亦步亦趋,坚持不懈。。。
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chongsleep

银虫 (小有名气)

这个问题终于被解决了。。。。
学习的道路上更要亦步亦趋,坚持不懈。。。
2楼2013-03-18 16:14:30
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chongsleep

银虫 (小有名气)

唉,我调整了分子键长之后,是没有出现虚频了,但四个收敛标准,只有两个是YES,我再接着用这个得到的结构,继续优化,再次出现了虚频了。。。
学习的道路上更要亦步亦趋,坚持不懈。。。
3楼2013-03-18 20:51:45
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