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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 请问一下高斯优化后的结构如何再用chem3d去看，因为想标注原子序数和元素符号
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biaoxue

木虫 (正式写手)

[求助] 请问一下高斯优化后的结构如何再用chem3d去看，因为想标注原子序数和元素符号

如题，请大神帮助
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1楼 2013-03-14 16:43:01
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ljxzhq88

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
将优化后的分子保存为gjf格式，然后用3D打开就可以了
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2楼2013-03-15 08:59:10
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biaoxue

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ljxzhq88 at 2013-03-15 08:59:10
将优化后的分子保存为gjf格式，然后用3D打开就可以了

我就是把优化后的原子坐标直接粘贴到editplus里吗？好像不行呀，是不是还得写什么其他语句呢？
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3楼2013-03-15 10:21:37
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ljxzhq88

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
biaoxue: 金币+5 2013-03-18 10:28:12
引用回帖:
3楼: Originally posted by biaoxue at 2013-03-15 10:21:37
我就是把优化后的原子坐标直接粘贴到editplus里吗？好像不行呀，是不是还得写什么其他语句呢？...

楼主貌似没听明白我的意思，优化好结构保存为gjf格式，直接用chem3D打开就行了，不用写其他的，chem3D上就可以标注元素符号和键长等等。。
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4楼2013-03-15 15:29:39
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biaoxue

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ljxzhq88 at 2013-03-15 15:29:39
楼主貌似没听明白我的意思，优化好结构保存为gjf格式，直接用chem3D打开就行了，不用写其他的，chem3D上就可以标注元素符号和键长等等。。...

就是把优化后的Out文件另存为gjf格式的哈，我试了，打不开么
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5楼2013-03-18 10:27:36
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sjc947440689

金虫 (初入文坛)
保存为pdb格式，chem3D就能打开了
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中华儿女千千万，实在不行咱就换
6楼2013-03-18 23:17:31
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ljxzhq88

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by biaoxue at 2013-03-18 10:27:36
就是把优化后的Out文件另存为gjf格式的哈，我试了，打不开么...

为嘛我的能打开呢？
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7楼2013-03-19 08:32:15
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biaoxue

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by sjc947440689 at 2013-03-18 23:17:31
保存为pdb格式，chem3D就能打开了

谢谢，我保存为gjf文件了，确实能打开
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8楼2013-03-19 13:53:08
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biaoxue

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by ljxzhq88 at 2013-03-19 08:32:15
为嘛我的能打开呢？...

谢谢，我今天又试了一下，确实可以，我是先在Gaussview中打开，然后再保存为gjf文件，最后用chem3D看的。
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9楼2013-03-19 13:54:19
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