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xiaoping1986

银虫 (著名写手)

[求助] 系统发育树

已经一株菌的16sRNA,怎样建立系统发育树？
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1楼 2013-03-07 21:45:07
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快乐的小胖墩

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
树树8013: 金币+2, 欢迎新虫友的到来。版主奖励。 2013-03-09 19:48:46
内容已删除
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2楼2013-03-08 13:21:22
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xiaoping1986

银虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 快乐的小胖墩 at 2013-03-08 13:21:22
把你测定的序列在NCBI网站上进行核酸BLAST比对，会出现很多相似性较高的菌株及其序列，然后选一些有代表性的菌株，并记住它们的序列号，再用DNAMAN之类的软件进行多序列比对，并建立系统发育树。

请问如何利用DNAMAN软件建立系统发育树，有没有软件的使用方法或教程之类的，谢谢！非常急！
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3楼2013-03-15 22:58:17
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谢伊莹

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

hsd3521: 应助指数+1 2013-03-23 09:56:35
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaoping1986 at 2013-03-15 22:58:17
请问如何利用DNAMAN软件建立系统发育树，有没有软件的使用方法或教程之类的，谢谢！非常急！...

DNAMAN是基于序列同源性来建树的 其结果不是那么的可靠 初学者推荐使用MEGA 当然最好使用PAUP或PHYLIP  PAUP使用难度有点大
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4楼2013-03-20 09:26:48
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xiaoping1986

银虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 谢伊莹 at 2013-03-20 09:26:48
DNAMAN是基于序列同源性来建树的 其结果不是那么的可靠 初学者推荐使用MEGA 当然最好使用PAUP或PHYLIP  PAUP使用难度有点大...

那有么有MEGA这个软件和教程，能教一下具体的方法吗？
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5楼2013-03-20 23:16:08
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谢伊莹

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by xiaoping1986 at 2013-03-20 23:16:08
那有么有MEGA这个软件和教程，能教一下具体的方法吗？...

http://wenku.baidu.com/view/96df8c49cf84b9d528ea7acc.html你是试试吧，网上很多资料
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6楼2013-03-21 09:07:33
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