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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化图形可视化软件 » 关于静电势的强弱问题？
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
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10楼: Originally posted by 阡陌蔓 at 2013-04-23 14:19:18
老师，按照您的帖子做了个图，但是有几个问题：1.图上没有极值点的小圆点，2.用的是点，不是透明的膜，3.屏幕一边明亮一边暗。
又一次麻烦老师了！

360截图-102315265.jpg
...

显示的时候在representation里把点的大小改大一些，让他们相互交叠起来，看起来就是个面了。如果你用POVray渲染器再渲染一下可能会更好看。

Multiwfn可以把极值点的坐标导出到pdb文件里。将此pdb文件载入到VMD里，并用适当大小的圆球方式显示它们，就能看到分子表面上的极值点位置了。

Display菜单里把Depth Cueing关掉可以解决发暗的问题。

作图时还有许多细碎、灵活的技巧，需要自行尝试、摸索，才能让图像对于当前的体系最美观、清晰。
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11楼2013-04-23 18:56:58
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tonglijia

木虫 (正式写手)
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4楼: Originally posted by sobereva at 2013-03-10 12:13:21
不对照色彩刻度就没法知道分子表面静电势图的各种颜色对应多大数值。
比如下面这张图

可见色彩刻度轴是从-40到48 (kcal/mol)，色彩渐变是：蓝-白-红。因此，在分子表面上，静电势为-40以及更负的区域对应 ...

老师，您好，请教您一个问题。根据“正电荷放到电势越高的地方电势能越大，负电荷放到电势越低的地方能量越大”的物理现象，是不是处于-43.20处的电子要比处在-8.34处的电子具有更高的能量？
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人，要靠自己！！！
12楼2017-03-17 11:23:29
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zhou2009

版主 (著名写手)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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12楼: Originally posted by tonglijia at 2017-03-17 11:23:29
老师，您好，请教您一个问题。根据“正电荷放到电势越高的地方电势能越大，负电荷放到电势越低的地方能量越大”的物理现象，是不是处于-43.20处的电子要比处在-8.34处的电子具有更高的能量？...

sobereva老师离开了本论坛。我试作答：静电势是拿一个正电荷从无限远的地方移至分子表面来测量各处性质的。静电势的正值大小表明对这个正电荷的斥力大小，此处的电子能级低，电子紧密，能量高，不易给出。静电势的负值大小表明对这个正电荷的引力大小。负值表明此处电子所处的能级，负值越大电子所处的能级越高，具有更低的能量，易于失去。负值常出现在孤对电子处，它易于给出电子形成氢键。
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13楼2017-03-17 15:43:30
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