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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 用MS的dicover模块如何求interaction energy
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fym11fym

木虫 (正式写手)

[求助] 用MS的dicover模块如何求interaction energy

在用MS模拟聚合物与碳纳米管间的相互作用，在文献上看到是这样计算的：
画出的图像如图：
我尝试了很多，但还是未能画出如图的曲线，希望会的高人指点指点

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期望在最美丽的时候遇见你
1楼 2013-03-05 08:38:15
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fym11fym: 金币+5, ★有帮助 2013-03-07 11:15:07
聚合物和碳纳米管体系的总能量- 碳纳米管能量 - 聚合物的能量
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2楼2013-03-06 16:34:14
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fym11fym

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cg陈 at 2013-03-06 16:34:14
聚合物和碳纳米管体系的总能量- 碳纳米管能量 - 聚合物的能量

我想问一下，具体用MS该如何操作呢
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期望在最美丽的时候遇见你
3楼2013-03-06 20:26:33
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
fym11fym: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-03-07 11:15:39
跑一个动力学就可以得到势能随着时间的变化曲线图，依次减去各部分能量随着时间的变化，剩下的就是相互作用能随着时间的变化曲线图了
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4楼2013-03-06 21:14:43
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fym11fym

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by cg陈 at 2013-03-06 21:14:43
跑一个动力学就可以得到势能随着时间的变化曲线图，依次减去各部分能量随着时间的变化，剩下的就是相互作用能随着时间的变化曲线图了

依次减去各自再跑依次动力学吗？但是再跑一次的话，曲线对应的点不一样啊，无法相减？？？
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期望在最美丽的时候遇见你
5楼2013-03-07 08:31:25
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)
每一祯内 都一个总势能 聚合物的势能 表面势能，
是否可以写一个脚本 提取每一祯这样的结果，最后画图？
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6楼2013-03-07 10:33:14
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fym11fym

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by cg陈 at 2013-03-07 10:33:14
每一祯内 都一个总势能 聚合物的势能 表面势能，
是否可以写一个脚本 提取每一祯这样的结果，最后画图？

我先试试，谢谢你
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期望在最美丽的时候遇见你
7楼2013-03-07 11:14:45
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