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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » DNASE1足迹法与EMSA中DNA探针的长度？
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mangmanglulu

金虫 (小有名气)

[交流] DNASE1足迹法与EMSA中DNA探针的长度？ 已有1人参与

请教各位大侠DNASE1足迹法与EMSA中DNA探针的最适宜长度是多少？如果我的DNA探针长度多长，用什么方法能将DNA片段缩短同时保留有可能结合的位点。
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1楼 2013-03-04 11:08:32
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无为书生

铁虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2013-03-06 17:14:23
DNA探针的长度要先看看文献，找找有没有相似序列，如果查不到的话就尽量取长一点，只有长一点，包含蛋白靶序列的几率才大一些，但也不能太长，不然会有非特异性结合的，最好是先做一些预实验，摸一下条件！祝实验顺利！
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2楼2013-03-04 16:11:27
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mangmanglulu

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 无为书生 at 2013-03-04 16:11:27
DNA探针的长度要先看看文献，找找有没有相似序列，如果查不到的话就尽量取长一点，只有长一点，包含蛋白靶序列的几率才大一些，但也不能太长，不然会有非特异性结合的，最好是先做一些预实验，摸一下条件！祝实验顺 ...

呃  我想请教一下 我的2000BP是不是有点长啊？
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3楼2013-03-04 16:41:11
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无为书生

铁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by mangmanglulu at 2013-03-04 16:41:11
呃  我想请教一下 我的2000BP是不是有点长啊？...

2000的话是有一点长了，毕竟还是要考虑到非特异性结合的，像调控蛋白质类的都会有非特异性结合，我之前用的是400-500bp，就这我还是感觉有点长了。文献上用的更短，好像是200以下吧，时间长了记不太清，你最好还是先看看文献再说。
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4楼2013-03-06 13:43:45
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