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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 为什么pwscf单节点8核运行比1个核还要慢?
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vallen

银虫 (正式写手)

[求助] 为什么pwscf单节点8核运行比1个核还要慢?

我用单节点,8核运行pw.x
mpirun -n 8 ./pw.x -input xx.in > log

察看了一下，cpu占用率都只有50%左右，
看了一下log文件，里面很多重复的内容，好像每个cpu都在各算各的，根本没有并行
这样还不如只用一个核心快

是不是我的命令有问题
怎么让单机8核并行呢
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1楼 2013-02-26 00:48:16
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souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
vallen: 金币+2 2013-02-27 10:47:55
说明编译的PWscf可能只是串行版～如果成功编译成了并行可执行文件，执行后的文件开头应该是：
引用回帖:
     Program PWSCF v.5.0.2 (svn rev. 9392) starts on  3Jan2013 at  1:42:26

     This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite
     for quantum simulation of materials; please cite
         "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);
          URL http://www.quantum-espresso.org",
     in publications or presentations arising from this work. More details at
     http://www.quantum-espresso.org/quote.php

     Parallel version (MPI), running on     6 processors
     R & G space division:  proc/nbgrp/npool/nimage =       6

并且文件内容不会有重复。
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思想重于技巧，内涵重于表象
2楼2013-02-26 10:53:32
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729267452lgl

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
vallen: 金币+3 2013-02-27 10:47:59
你是不是没有安装并行的程序，所以没有并行。再说如果单个核就很快计算的东西，如果用8个核肯定要慢，因为核多的话需要给每个核分配任务，这也需要很长时间。
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3楼2013-02-26 16:57:13
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vallen

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by souledge at 2013-02-26 10:53:32
说明编译的PWscf可能只是串行版～如果成功编译成了并行可执行文件，执行后的文件开头应该是：

并且文件内容不会有重复。...

是并行版本，我的开头是这样的，只用一个节点进行计算
，开始就有很多重复的内容

WARNING: Unable to read mpd.hosts or list of hosts isn't provided. MPI job will be run on the current machine only.

     Program PWSCF v.5.0.2 (svn rev. 9392) starts on 25Feb2013 at 14:37:24

     This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite
     for quantum simulation of materials; please cite
         "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);
          URL http://www.quantum-espresso.org",
     in publications or presentations arising from this work. More details at
     http://www.quantum-espresso.org/quote.php

     Parallel version (MPI), running on     1 processors

     Current dimensions of program PWSCF are:
     Max number of different atomic species (ntypx) = 10
     Max number of k-points (npk) =  40000
     Max angular momentum in pseudopotentials (lmaxx) =  3
     Reading input from pt.2.in

     Program PWSCF v.5.0.2 (svn rev. 9392) starts on 25Feb2013 at 14:37:24

     This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite
     for quantum simulation of materials; please cite
         "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);
          URL http://www.quantum-espresso.org",
     in publications or presentations arising from this work. More details at
     http://www.quantum-espresso.org/quote.php

     Parallel version (MPI), running on     1 processors
底下还有很多重复

好像就是8个核算得同样的东西都放在了一个文件里

这是怎么回事，难道单节点不能多核运行吗
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4楼2013-02-26 18:46:42
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vallen

银虫 (正式写手)
找到方法了，用openmp重新进行编译就好了
openmp就是用来多线程计算的
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5楼2013-02-27 10:46:42
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txwang

金虫 (初入文坛)
Your problem is not wholly solved. There is some problem in your compilation with MPI!!!
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6楼2014-04-04 21:33:09
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lesite

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by vallen at 2013-02-27 10:46:42
找到方法了，用openmp重新进行编译就好了
openmp就是用来多线程计算的

你这个是编译的串行多线程版的吧 我之前编译是并行版的 运行例子都正常，但一做任务就报错。还有 对于单CPU多核计算机 是否只能正常运行串行版本？并行是多CPU才有意义吧？
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7楼2015-03-11 19:08:35
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lesite

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by txwang at 2014-04-04 21:33:09
Your problem is not wholly solved. There is some problem in your compilation with MPI!!!

具体会是什么问题？我之前编译并行版也遇到类似的问题，打开程序显示是并行版本，运行示例没有问题，但一运行任务就显示psedo file找不到，又或者等待input文件。。。
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8楼2015-03-11 19:10:50
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