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lyfhd008

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diatom7890

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 金币+5, 谢谢详尽的解释 2013-02-15 07:20:22
lyfhd008: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 十分感谢啊! 2013-02-15 08:56:09
所有聚类分析都是根据样本之间的距离来计算的,bray-curtis距离是反应两个群落差异性方面最常用的指标,大部分生态学家喜欢用这个指标表征两个群落的差异性。你做DGGE时,每个条带可以看做一个群落,用这个指标恰好可以满足条件。另外还有一些距离指标可以计算,比如纯粹的马氏距离方法等。不过bray-curtis更被生态学家所接受,因为其采用的基础数据试有无该物种,也就是该物种在一个群落中是否存在。这是因为1:各个物种的权重存在很大不同;2物种随着时间的变化很大,这一刻很少,但是下一刻就可能很多,所以不论多少,该物种在群落中都是存在的。
垂死病中惊坐起 一只熊猫出墙来
2楼2013-02-14 17:48:11
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lyfhd008

禁虫 (小有名气)

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3楼2013-02-15 08:58:02
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diatom7890

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wizardfan: 金币+2, BioEPI+1, 谢谢补充,回答得很到位,以后保持 2013-02-16 08:08:19
引用回帖:
3楼: Originally posted by lyfhd008 at 2013-02-15 08:58:02
请问有没有这方面的资料书或文献都行,想好好看看这方面资料,谢谢!...

可以参见这个pdf
http://www.econ.upf.edu/~michael/stanford/maeb5.pdf

另外如果对R软件熟悉的话,可以参考R中的vegan和ecodist这两个包,这两个包都涉及到了生态距离的计算

祝好运

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垂死病中惊坐起 一只熊猫出墙来
4楼2013-02-15 17:25:44
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lyfhd008

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5楼2013-02-16 20:38:21
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diatom7890

木虫 (正式写手)


amisking: 金币+1, 鼓励发帖交流问题。 2013-02-16 21:22:21
内容已删除
垂死病中惊坐起 一只熊猫出墙来
6楼2013-02-16 21:00:58
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