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jialebaby

铁虫 (小有名气)

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专业: 水产生物遗传育种学

[交流] 多态信息含量计算软件PIC_CALC

呵呵，这是自己写的一个多态信息含量计算程序。因为位点多态信息含量的计算手工比较麻烦，而且没有专门的软件进行计算。因此自己手写了一个。
网速太慢，不能够上传，大家到这里下载吧
http://hi.baidu.com/luansheng122 ... fc5e338744f9d3.html

Changes:
版本0.6 2007-04-22
计算多个位点的多态信息含量即PIC值。
版本0.1 2006-11-03
计算一个位点的PIC含量。

程序使用说明：
用记事本建立一个扩展名为dat的文本文件，格式如下：
每一行是一个位点所有等位基因频率，其书写格式：
位点名称该位点等位基因数目然后依次为每个等位基因在群体中的频率，依次用空格隔开
如下所示（参见：example.dat范例文件）。
locus1 9 0.05 0.1  0.1 0.1 0.1 0.1 0.2  0.2 0.05
locus2 8 0.1 0.1 0.1 0.1 0.2 0.1 0.1 0.2
locus3 5  0.2 0.1 0.02 0.4 0.28
locus4 6 0.1 0.05 0.0012 0.0088 0.44 0.4

操作步骤:
1)点击文件菜单－>open，选择数据文件
2)选择数据文件后，会在“位点等位基因频率”区域显示位点等位基因频率
3)点击“计算PIC”按钮，在“位点PIC结果”区域中显示计算结果

[ Last edited by jialebaby on 2007-8-14 at 13:31 ]

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